Operaの文字化けは私の環境でも出ました。
下記のサイトを参考に修正しましたが、私の場合、下記のサイトの内容のままではフォントが入っていなかったのか直らなかったと記憶しています。
現在の設定内容は帰宅すれば確認できますので、少し待ってもらえれば数日中には修正内容を投稿します。
もし、自力で修正に取り組むのであれば、変更前の内容を必ずバックアップとっておいて下さい。

http://eunheui.cocolog-nifty.com/ubuntu/2009/03/ubuntu-opera-b6.html

ユーチューブではシナプティクスマネージャーからアドビのフラッシュをインストールしたら正常に動画が見れました。アドビのサイトからフラッシュをインストールしたら、動画は見れませんでした。

前にもお願いしましたが、基本的に1トピックに対しては、1つの質問で閉じて下さい。タイトルから内容が判らなくなります。
一般論ですが、システムが用意している方法でインストールできるものは必ずシステムの方法でインストールして下さい。
それ以外の方法でインストールするものは、(ある程度は)自力で問題に対処できるものだけにして下さい。

> システムが用意している方法とはシナプティクスマネージャーを使うと言う事でしょうか。
基本的にはそうですね。
同様のものとしてapt-getやaptitudeなどもありますが。

すいません。設定ファイルの件は記憶違いだったようで、下記サイトのままでした。
http://eunheui.cocolog-nifty.com/ubuntu/2009/03/ubuntu-opera-b6.html

記憶が曖昧なのでアレですが、念のためttf-vlgothicパッケージが入っているかは確認しておいた方がよいでしょう。端末で下記を実行下さい。

sudo apt-get install ttf-vlgothic

/usr/share/opera/ini/font.ini
というファイルを一行書き換えるだけです。やり方は、端末で
sudo gedit /usr/share/opera/ini/font.ini
で、
Known fonts that solves specific problems （英語が間違ってますが）のセクションにある
family:kochi*=japanese good try-first
という行を
family:vl*=japanese good try-first
に書き換えます。

うにさんに感謝。

解決されたようなので、蛇足ですが、

シナプティクスでは、アドビやオペラが検索から探してもなかなか見つけられません。

フラッシュはflashで検索すれば引っかかるかと思います。operaはなかったように記憶しています。

E: ロック /var/lib/dpkg/lock が取得できませんでした - open (11 Resource temporarily unavailable)
E: Unable to lock the administration directory (/var/lib/dpkg/), is another process using it?

これはすでに自動更新マネージャか、synapticかなにかが、動いているために、apt-getを起動できなかったということを通知するエラーメッセージです。
少し時間をおいて、何度か試すと正常にapt-getを起動できます。
その後、問題なくoperaが使えているとのことなので、すでにインストール済みだったのでしょう。

so@ubuntu:~$ sudo gedit /usr/share/opera/ini/font.ini
これを実行して、回答のようにファイルを書き換えたら、成功しました。改善されたようです。以上簡単なご報告です。ご回答、ご協力有難うございます。

こういう簡単な顛末を報告していただけると非常に助かります。
もし、同じ問題に遭遇した人がでたとき、参考になるトピックとなることでしょう。
ご協力感謝します。