kaznon による投稿:

こちらのフォーラムで、アップデートには カーネルやソフトウェア、セキュリティーに関するものがありますので、（他にもあるのかな？）必ず 行ったほうが良いと教えていただきました。

kaznon による投稿:

アップデートはせずに、アップデートの通知さえ切っている状態です。（特に　USB-HDD UBUNTUは、ブートＣＤを作り変えなければな
りません）←この使い方間違いでしょうか？

バージョンアップのアップデート(アップグレード)でなく、普段のアップデートは行った方が良いと考えます。
少なくともセキュリティに関するアップデートは、少ない確率ではありますが自分が被害者でなく加害者になる可能性から行うべきかと思います。

各々の使い方にあったアップデートの設定は
http://gihyo.jp/admin/serial/01/ubuntu-recipe/0083
が参考になるかと思います。

kaznon による投稿:

（特に　USB-HDD UBUNTUは、ブートＣＤを作り変えなければなりません）

これに関しては、例えば私なら「ブートCDがないとUSBから起動できないそのPC側が問題だ」と考えます。
アップデートのスムーズな運用が出来ないハードウェア環境はそもそもUbuntuを日常的に、少なくともインターネットに接続して使うのに適していないという判断です。
※「日常的じゃない」使い方・・・例えばネットに繋がずデジタルフォトフレームのごとく写真をスライドショーし続けるとか、インターネットに出ないLANのみのサーバ等・・・は別として。

ので
・使い方を変える
・PCを変える
・自己責任で突き進む
の3択かと思います。

kaznon による投稿:

例えば、ubuntu tweakぐぐって
下記ページから
http://ubuntu-tweak.com/downloads
ubuntu-tweak_0.4.8-1~jaunty1_all.deb のパッケージファイルをダブルクリックしてインストしました。
この操作は間違いなのでしょうか？

何を「間違い」とするかですが、例えば少なくとも上記操作でubuntu tweakをインストールした環境は、Ubuntuとしては次のバージョンへ
問題なくアップグレードできるかどうか責任持たない、という事かと思います。

kaznon による投稿:

又、ミズノさんの発言で tar玉ファイルですが、私の認識では、圧縮されたパッケージファイルでdebと圧縮形式がちがうだけ？？なのですが・・
間違ってますか？

確かに圧縮形式も違いますが、tar玉 というのは一般的に中身はソースコードで、中身を展開してコンパイル、ビルドしてアプリを生成してからそれを所定の位置に置いて(＝インストール)使います。
Ubuntuの普段ダウンロードしている .deb は
・アプリの実行ファイルで入っている(ソースコードは別途 apt-get source 等で入手)
・Ubuntuに合うようにインストール先や設定が加工されている
・パッケージ管理システムの管轄化にある
という感じです(例外もありますが)。

kaznon による投稿:

どの ソフトがどのリポジトリに属しているのか？

いろいろ調査方法がありますが、例えばWebブラウザでやるなら
http://packages.ubuntu.com/jaunty/
が使えるかと思います。

kaznon による投稿:

又、上記 四種類以外に どのような リポジトリの登録をしておいたほうがいいのか？

Ubuntuチームとしての見解はその4種類以外にはないはずです。
追加リポジトリに関しては「我々として責任は持たないがやるならご自由に」というものかと思います。