おそらくですが、
http://wiki.debian.org/BOINC#head-b729364a6b5e64e82b8708b8e9e6c39e95afaff6
が参考になると思います。

Synapticパッケージマネージャで見つかった

bonic-client
bonic-manager

で動いてくれました！

ただ、今のところきちんと動作しているのか分からずにいます…

「他にもリポジトリが必要だ」ということや「設定をこうすればきちんと動く」
といったことをご存知の方がいらっしゃいましたら、
どうかお教えください。
お願いします。

じっぺい による投稿:

後はBOINC Managerを自動起動するように設定できればいいのですが… :(

この意図はどちらになるでしょう？
　1. PC起動時にWCGノードとして機能するようにしたい。
　2. 起動したら、BOINC Manager GUIを見たい。

1. はパッケージインストール時に/etc/default/boinc-clientで、すでに
　行われています。PC起動時に自動的にboinc_clientが起動しているはずです。

2. はGNOMEのセッション機能を使えばよいでしょう。
　設定メニューにたどり着く経路は違いますが、以下を参照してください。
　http://www.atmarkit.co.jp/flinux/rensai/linuxtips/869autorunfc.html