あまりややこしいことをしない方が良いとは思うのですが･･･。
SATA だけに Ubuntu をインストールして、空いている IDE は Windows と Ubuntu から共有出来るデータ領域みたいな使い方ではダメなんですか？

GRUB のインストール先は、順当にやるならもちろん MBR にインストールしないと、Ubuntu が起動出来ません。Windows が起動してしまいます。
PBR にインストールしたいのなら、NTLDR から起動するように細工をする必要があります。

BIOSの設定については、M/Bの型式情報が必要になりますし、マニュアルなどが公開されていないと試行錯誤が必要になるかも知れません。また、どのようにインストールするかを先に決めた方がよいです。
IDEのドライブが2個と、SATAのドライブの混在で問題が起きないかは確認済でしょうか。BIOSによってはおかしな挙動を示す可能性もあるので、最初に確認された方がよろしいかと思います。
grubのインストール先も上記の結果によるかと思います。

訂正

かぜひきさん による投稿:

うちのマザボ(Biostar P4M80-M4)だと、IDEから起動すると次回起動はIDE。SATAから起動すると自壊機同はSATAとなるようです。

確かに壊れてるのは私。

うちのマザボ(Biostar P4M80-M4)だと、IDEから起動すると次回起動はIDE。SATAから起動すると次回起動はSATAとなるようです。

S-ATA と IDE の混在が問題ないと仮定しての話になりますが、スレーブから起動を掛けるというのは、トラブルが起きた時に切り分けるのが大変になるので避けておいた方が無難かと思います。
(必ずトラブルの原因になるという訳ではないのですが)
petitbootangさんのおっしゃる通り、スレーブのIDEドライブは共用にするのがいいのではないかと思います。

S-ATA
    / /boot
    /home /usr/local など
    /swap
IDEマスター WindowsXP
IDEスレーブ 共用エリア

このような構成にして、S-ATA の MBR に grub をインストール。BIOSで S-ATAから起動するように設定するのはどうでしょうか。
こうしておけば Ubuntu が何らかの要因で起動できなくなった時、BIOS の切り替えのみで XP を起動する事ができ急場はしのげます。
もっとも LiveCD もあるのでそれ程アドバンテージになる事でもないとは思いますが。
また、そのままでは XP が上手く起動できないかもしれません。その場合は /boot/grub/menu.lst を適宜変更する必要があります。
現象が生じた時にまたご相談頂ければと思います。

共用エリアは ntfs フォーマットでも扱えますが、4Gくらいのファイルを ntfs領域に移動しようとしたら、コケた事があるので注意が必要かもしれません。FAT32 の方が安全かもしれませんね。
この辺は識者の方からアドバイスが頂ければ助かります。

GHOさん　hir0さん　どうもありがとうございます。

SATAの方へ9.04をインストールしてgrubをsda(Winが入っているIDEマスタ)へインストールしましたが、
起動選択画面も何も出ず、スクリーンが真っ黒なままでした。

もうWinXPは要らないので、IDEのHDDを取り外してSATA1台の単純な構成にしたいと思います。
せっかく皆様方にお知恵をお借りしたのに、自分の技量のなさからとてもトラブルに対応できないと思いました。
繋げば何でも動くだろうと軽い気持ちで、組み込んだ私がおバカでした。

あす、SATAにインストールして(1台構成なら私にもできます・笑)ケースのフタ閉めます(もうPCの中見たくない・・・)

皆様有難うございました、本当にすみませんでした。

SATAの方へ9.04をインストールしてgrubをsda(Winが入っているIDEマスタ)へインストールしました

全然OK、回復（XPの起動）は出来ます。
早まらずにHDDをデータ用などで上書きする前にもう一度このトピックを見ていただければ良いのですが、、、

対策としてはMBRのブートローダーの問題なので（基本的にgrubで問題は無いはず、要、設定の再調整）
・grubのmenu.lst等の設定変更
・WinのNTLDRのインストール（fixmbr）
・別のブートローダーの導入

grubの設定の変更に付いては試行錯誤（情報の提示や結果の報告）が伴います。
現状の確認も必要です、真っ黒な画面に何か白抜きで文字が無いでしょうか、あれば報告を。

ライブCDからWindows（上部パネル->場所->?GBのメディア）のCドライブを確認して下さい、実際に上書き消去等されていないことを確認です。

そのまま端末から
$ sudo fdisk -l
最後の「l」は小文字のエルです。空白を含む全てが半角英数です。
もちろんHDDは全て繋いだ状態でお願いします。その結果を投稿してください。

次に
$ gedit /boot/grub/menu.lst
の結果を。

・ブラック画面の文字の有無、
・２つのコマンドの実行結果
・回復コンソールの使用の不可
・別ブートローダーの使用の賛否

をお願いします。
多分落ち込んでるだろうなぁ、やったときのショックは表現出来ないくらい情緒不安定で鬱ぎ込むんだよなぁ。
消去する前に見てくれれば良いんですが、、、

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フォーラムの皆様この度はどうも有難うございました。

ふがいない者のためにお時間を割いて頂きましたのに、自分の技量の無さから
すっきりとした締め方にならず、申し訳ないと思っています。

UbuntuOSやソフトウェアがどんどんと進化してすごいなぁ、と感じていましたら
ハード面も素晴らしく進化しているんですね。
今回PCを再構成するにあたり、ショップを覗いたらパーツの多様さにビックリこきました。
なにせ、自分の頭の中はまだ、初期Pen3時代のまま進化していませんでした。(大笑)

これからは、苦手なPCのハード的な中身も少しずつ勉強して見ようと考えています。
とりあえず今の時代に追いつかなければと・・・　(,汗)

また、いろいろと躓いてお世話になることがあるかもしれませんが、今回に懲りず
よろしくお願い致します。

どうも有難うございました。　　　oiyan