バグっぽいです。
https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/sysvinit/+bug/468589

wubiであれば、Windows領域にデータを退避させることができると思いますので、バックアップをとってから、インストールしなおしてしまうのが簡単かと思います。

http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=738866&page=2
の最後の方法で直るかも知れませんが、いずれにしても先にバックアップはとっておいて下さい。

まあ英語と言っても#14はほとんどがコマンドなので。
ぶっちゃけ、バックアップをとってからWindowsを一度起動して、wubiのアンインストール、新しいバージョンのUbuntuをwubiでインストールが一番楽ちんかと思います。

hmatsue様、hida様、アドバイスいただきありがとうございます。
hmatsue様の方法でいこうと思います。

ちなみに私がWubiでUbuntuを使っているのは、4年半後にXPのサポートが切れるのを期にUbuntuに完全移行するつもりで、それまでの間に少しでもUbuntuに慣れておこう、というのが理由です。