今は、xorg.confを削除してドライバもアンインストールしました。
状況としては何をしてもハードウェア・ドライバに何も表示されない感じです。
その後、ubuntuで認識されてるドライバを調べたところ、ATI RADEON X1250ではなくX1200として認識してました。（完全に誤認識ですね）
もう何がなんだかさっぱりです。:(

返事が遅れてごめんなさい。

00:00.0 Host bridge: ATI Technologies Inc RS690 Host Bridge
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 64
    Kernel modules: ati-agp

00:01.0 PCI bridge: ATI Technologies Inc RS690 PCI to PCI Bridge (Internal gfx)
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 99
    Bus: primary=00, secondary=01, subordinate=01, sec-latency=68
    I/O behind bridge: 0000d000-0000dfff
    Memory behind bridge: fdd00000-fdefffff
    Prefetchable memory behind bridge: 00000000f8000000-00000000fbffffff
    Capabilities: <access denied>
    Kernel modules: shpchp

00:07.0 PCI bridge: ATI Technologies Inc RS690 PCI to PCI Bridge (PCI Express Port 3)
    Flags: bus master, fast devsel, latency 0
    Bus: primary=00, secondary=02, subordinate=02, sec-latency=0
    I/O behind bridge: 0000e000-0000efff
    Memory behind bridge: fdc00000-fdcfffff
    Prefetchable memory behind bridge: 00000000fdf00000-00000000fdffffff
    Capabilities: <access denied>
    Kernel driver in use: pcieport-driver
    Kernel modules: shpchp

00:12.0 SATA controller: ATI Technologies Inc SB600 Non-Raid-5 SATA (prog-if 01)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 64, IRQ 22
    I/O ports at ff00 [size=8]
    I/O ports at fe00 [size=4]
    I/O ports at fd00 [size=8]
    I/O ports at fc00 [size=4]
    I/O ports at fb00 [size=16]
    Memory at fe02f000 (32-bit, non-prefetchable) [size=1K]
    Capabilities: <access denied>
    Kernel driver in use: ahci

00:13.0 USB Controller: ATI Technologies Inc SB600 USB (OHCI0) (prog-if 10)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 64, IRQ 16
    Memory at fe02e000 (32-bit, non-prefetchable) [size=4K]
    Kernel driver in use: ohci_hcd

00:13.1 USB Controller: ATI Technologies Inc SB600 USB (OHCI1) (prog-if 10)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 64, IRQ 17
    Memory at fe02d000 (32-bit, non-prefetchable) [size=4K]
    Kernel driver in use: ohci_hcd

00:13.2 USB Controller: ATI Technologies Inc SB600 USB (OHCI2) (prog-if 10)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 64, IRQ 18
    Memory at fe02c000 (32-bit, non-prefetchable) [size=4K]
    Kernel driver in use: ohci_hcd

00:13.3 USB Controller: ATI Technologies Inc SB600 USB (OHCI3) (prog-if 10)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 64, IRQ 17
    Memory at fe02b000 (32-bit, non-prefetchable) [size=4K]
    Kernel driver in use: ohci_hcd

00:13.4 USB Controller: ATI Technologies Inc SB600 USB (OHCI4) (prog-if 10)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 64, IRQ 18
    Memory at fe02a000 (32-bit, non-prefetchable) [size=4K]
    Kernel driver in use: ohci_hcd

00:13.5 USB Controller: ATI Technologies Inc SB600 USB Controller (EHCI) (prog-if 20)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 64, IRQ 19
    Memory at fe029000 (32-bit, non-prefetchable) [size=256]
    Capabilities: <access denied>
    Kernel driver in use: ehci_hcd

00:14.0 SMBus: ATI Technologies Inc SBx00 SMBus Controller (rev 14)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: 66MHz, medium devsel
    I/O ports at 0b00 [size=16]
    Capabilities: <access denied>
    Kernel driver in use: piix4_smbus
    Kernel modules: i2c-piix4

00:14.1 IDE interface: ATI Technologies Inc SB600 IDE (prog-if 8a [Master SecP PriP])
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 64, IRQ 16
    I/O ports at 01f0 [size=8]
    I/O ports at 03f4 [size=1]
    I/O ports at 0170 [size=8]
    I/O ports at 0374 [size=1]
    I/O ports at f900 [size=16]
    Kernel driver in use: pata_atiixp

00:14.2 Audio device: ATI Technologies Inc SBx00 Azalia (Intel HDA)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, slow devsel, latency 64, IRQ 16
    Memory at fe024000 (64-bit, non-prefetchable) [size=16K]
    Capabilities: <access denied>
    Kernel driver in use: HDA Intel
    Kernel modules: snd-hda-intel

00:14.3 ISA bridge: ATI Technologies Inc SB600 PCI to LPC Bridge
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 0

00:14.4 PCI bridge: ATI Technologies Inc SBx00 PCI to PCI Bridge (prog-if 01)
    Flags: bus master, VGA palette snoop, 66MHz, medium devsel, latency 64
    Bus: primary=00, secondary=03, subordinate=03, sec-latency=64
    I/O behind bridge: 0000c000-0000cfff
    Memory behind bridge: fdb00000-fdbfffff
    Prefetchable memory behind bridge: fda00000-fdafffff

00:18.0 Host bridge: Advanced Micro Devices [AMD] K8 [Athlon64/Opteron] HyperTransport Technology Configuration
    Flags: fast devsel
    Capabilities: <access denied>

00:18.1 Host bridge: Advanced Micro Devices [AMD] K8 [Athlon64/Opteron] Address Map
    Flags: fast devsel

00:18.2 Host bridge: Advanced Micro Devices [AMD] K8 [Athlon64/Opteron] DRAM Controller
    Flags: fast devsel

00:18.3 Host bridge: Advanced Micro Devices [AMD] K8 [Athlon64/Opteron] Miscellaneous Control
    Flags: fast devsel
    Capabilities: <access denied>
    Kernel driver in use: k8temp
    Kernel modules: k8temp

01:05.0 VGA compatible controller: ATI Technologies Inc RS690 [Radeon X1200 Series]
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 0e0b
    Flags: bus master, fast devsel, latency 64, IRQ 18
    Memory at f8000000 (64-bit, prefetchable) [size=64M]
    Memory at fdef0000 (64-bit, non-prefetchable) [size=64K]
    I/O ports at de00 [size=256]
    Memory at fdd00000 (32-bit, non-prefetchable) [size=1M]
    Capabilities: <access denied>
    Kernel modules: radeon

02:00.0 Ethernet controller: Realtek Semiconductor Co., Ltd. RTL8111/8168B PCI Express Gigabit Ethernet controller (rev 01)
    Subsystem: Foxconn International, Inc. Device 8168
    Flags: bus master, fast devsel, latency 0, IRQ 25
    I/O ports at ee00 [size=256]
    Memory at fdcff000 (64-bit, non-prefetchable) [size=4K]
    [virtual] Expansion ROM at fdf00000 [disabled] [size=128K]
    Capabilities: <access denied>
    Kernel driver in use: r8169
    Kernel modules: r8169


やはりRadeon X1200 Seriesとあるので誤認識っぽいです

それがどうもfglrxがうまく認識してないみたいなんです。
まずrunファイルのドライバーをdebパッケージ化してxorg.confを編集したいんですが設定が悪いのかXwindowが起動しなくなります。
この場合xorg.confをどのように設定すればいいでしょうか。

オフィシャルのドライバーを使ってみてはどうでしょうか？

http://support.amd.com/us/gpudownload/linux/Legacy/Pages/radeon_linux.aspx?type=2.7&product=2.7.4.3.3.3.1&lang=English

リンク先からドライバーをダウンロードしたら

$ cd /heme/ユーザー名/ダウンロード
$ sudo sh ati-driver-installer-9-3-x86.x86_64.run
パスワードを要求してくるのでログイン時のパスワードを入力する。

コマンド実行後に、GUIでドライバーのインストールウィザードが立ち上がるので画面の指示に従って進んで下さい。
完了後に再起動し「外観の設定」から「追加効果」を選択するとCompizが使えると思います。
メニュー項目の中にATI　Catalyst　Control Center が登録されているので細かい設定はそちらで行って下さい。
上手くいくかどうか分かりませんがお試し下さい。

PCはこれですよね？
http://www2.acer.co.jp/products/desktop/vtl410_m/spec_380516h.html

う～む？？
仕様には確かにATI Radeon™ X1250と書いてあるので、ドライバーもリンク先のものでよいと思うのですが…。
英語が苦手なのでエラーの内容は、残念ながら良く分かりませんが恐らく現在のカーネルのバージョンには上手く当たらない
というかかみ合わないのかも知れないということなのかな？？？
Ubuntuの人注バージョンは試されたのでしょうか？？？
何れのドライバーも当たらないのであれば現時点では厳しいのかな？？？
ところでxorg.confの中身はどうなっていますか？
カードとドライバーが違うから参考にならないかもしれませんが
とりあえず家のコードを貼って置きますね。

Section "Screen"
    Identifier    "Default Screen"
    DefaultDepth    24
EndSection

Section "Module"
    Load    "glx"
EndSection

Section "Device"
    Identifier    "Default Device"
    Driver    "fglrx"
EndSection

すみません都合上、mintのものですのでご了承下さい。

返事遅れてごめんなさい。
runファイルが無理みたいなんで、debパッケージ化してそのxorg.confをつかってみます

あ、それとhttp://wiki.cchtml.com/index.php/9.11
てのを見つけたんですけど信頼性ありますかね？

Sirius Lux による投稿:

debによりインストールしてxorg.confを書き換えました。
ところが起動時にローグラフィックモードで起動しろみたいな感じのメニューが出てきたので素直に起動しました。
そして、ハードウェア・ドライバで確認したところドライバー自体は入っているみたいなんですけど有効になりません。
後もう少しってとこみたいです。

どこのサイトを参考にしたのか公開したほうが回答者にも伝わりやすいのではないでしょうか？
それと、ドライバーの導入方法は前に示した通りです。
さらに図式で詳しくあなたの示したリンク先に書いてあります。
詳細は、前レスにてふれましたので参考にして下さい。

tnc による投稿:

仕様には確かにATI Radeon™ X1250と書いてあるので、
ドライバーもリンク先のものでよいと思うのですが…。
残念ながら良く分かりませんが恐らく現在のカーネルのバージョンには上手く当たらない
というか、かみ合わないのかも知れないということなのかな？？？

私もtncさんの想定が的を射ていると思います。
結構ATIのドライバーは、NVIDIAと比較して私の経験上では若干トラブルが多いです。

私のマシンのUbuntu8.04では問題なくRadeon X1650 XTが稼働しています。参考になるかどうか。。。
AMDからダウンロードしたati-driver-installer-9-1-x86.x86_64.runで、動作しています。

00:00.0 Host bridge: Silicon Integrated Systems [SiS] 661FX/M661FX/M661MX Host (rev 11)
00:01.0 PCI bridge: Silicon Integrated Systems [SiS] SiS AGP Port (virtual PCI-to-PCI bridge)

01:00.0 VGA compatible controller: ATI Technologies Inc Radeon X1650 XT (Primary) (PCIE) (prog-if 00 [VGA controller])
    Subsystem: C.P. Technology Co. Ltd Unknown device 2206
    Flags: bus master, 66MHz, medium devsel, latency 255, IRQ 16
    Memory at d0000000 (32-bit, prefetchable) [size=256M]
    I/O ports at d000 [size=256]
    Memory at e1000000 (32-bit, non-prefetchable) [size=64K]
    [virtual] Expansion ROM at e0000000 [disabled] [size=128K]
    Capabilities: <access denied>

01:00.1 Display controller: ATI Technologies Inc Radeon X1650 XT (Secondary) (PCIE)
    Subsystem: C.P. Technology Co. Ltd Unknown device 2207
    Flags: 66MHz, medium devsel
    Memory at e1010000 (32-bit, non-prefetchable) [disabled] [size=64K]
    Capabilities: <access denied>

端末にて操作します。
~$ cd /ダウンロード先ディリクトリー
　　note: ダウンロードしたディレクトリーに移行します。
~$ ls
　　note: atiのドライバー設定の実行ファイルの確認をします。
~$ sudo ./ati-driver-installer-9-1-x86.x86_64.run
　　note: ダウンロードしたファイル名によって、そのバージョンがちがいます
　　　　　現在は..9-3-x86...が最新のようです。私はその前のものを使っています。

参考に、私の環境でのxorg.confです。

# xorg.conf (X.Org X Window System server configuration file)
#
# This file was generated by dexconf, the Debian X Configuration tool, using
# values from the debconf database.
#
# Edit this file with caution, and see the xorg.conf manual page.
# (Type "man xorg.conf" at the shell prompt.)
#
# This file is automatically updated on xserver-xorg package upgrades *only*
# if it has not been modified since the last upgrade of the xserver-xorg
# package.
#
# If you have edited this file but would like it to be automatically updated
# again, run the following command:
#   sudo dpkg-reconfigure -phigh xserver-xorg

Section "ServerLayout"
    Identifier     "Default Layout"
    Screen      0  "aticonfig-Screen[0]-0" 0 0
EndSection

Section "Files"
EndSection

Section "Module"
    Load  "glx"
EndSection

Section "InputDevice"
    Identifier  "Generic Keyboard"
    Driver      "kbd"
    Option        "XkbRules" "xorg"
    Option        "XkbModel" "jp106"
    Option        "XkbLayout" "jp"
    Option        "XkbOptions" "lv3:ralt_switch"
EndSection

Section "InputDevice"
    Identifier  "Configured Mouse"
    Driver      "mouse"
    Option        "CorePointer"
EndSection

Section "Monitor"
    Identifier   "Configured Monitor"
EndSection

Section "Monitor"
    Identifier   "aticonfig-Monitor[0]-0"
    HorizSync    27.0 - 86.0
    VertRefresh  50.0 - 160.0
    Gamma        1
    ModeLine     "640x480@60" 25.2 640 656 752 800 480 490 492 525 -hsync -vsync
    ModeLine     "640x480@75" 31.5 640 656 720 840 480 481 484 500 -hsync -vsync
    ModeLine     "640x480@85" 36.0 640 696 752 832 480 481 484 509 -hsync -vsync
    ModeLine     "800x600@60" 40.0 800 840 968 1056 600 601 605 628 +hsync +vsync
    ModeLine     "800x600@72" 50.0 800 856 976 1040 600 637 643 666 +hsync +vsync
    ModeLine     "800x600@75" 49.5 800 816 896 1056 600 601 604 625 +hsync +vsync
    ModeLine     "800x600@85" 56.3 800 832 896 1048 600 601 604 631 +hsync +vsync
    ModeLine     "832x624@75" 57.3 832 864 928 1152 624 625 628 667 -hsync -vsync
    ModeLine     "1024x768@85" 94.5 1024 1072 1168 1376 768 769 772 808 +hsync +vsync
    ModeLine     "1024x768@75" 78.8 1024 1040 1136 1312 768 769 772 800 +hsync +vsync
    ModeLine     "1024x768@70" 75.0 1024 1048 1184 1328 768 771 777 806 -hsync -vsync
    ModeLine     "1024x768@60" 65.0 1024 1048 1184 1344 768 771 777 806 -hsync -vsync
    ModeLine     "1152x864@75" 108.0 1152 1216 1344 1600 864 865 868 900 +hsync +vsync
    ModeLine     "1280x1024@75" 135.0 1280 1296 1440 1688 1024 1025 1028 1066 +hsync +vsync
    ModeLine     "1280x960@60" 102.1 1280 1360 1496 1712 960 961 964 994 -hsync +vsync
    ModeLine     "1280x960@85" 148.5 1280 1344 1504 1728 960 961 964 1011 +hsync +vsync
    ModeLine     "1280x1024@60" 108.0 1280 1328 1440 1688 1024 1025 1028 1066 +hsync +vsync
    ModeLine     "1280x960@75" 129.9 1280 1368 1504 1728 960 961 964 1002 -hsync +vsync
    ModeLine     "1400x1050@60" 122.6 1400 1488 1640 1880 1050 1051 1054 1087 -hsync +vsync
    ModeLine     "1400x1050@75" 155.8 1400 1496 1648 1896 1050 1051 1054 1096 -hsync +vsync
    ModeLine     "1600x1200@65" 175.5 1600 1664 1856 2160 1200 1201 1204 1250 +hsync +vsync
    ModeLine     "1600x1200@60" 162.0 1600 1664 1856 2160 1200 1201 1204 1250 +hsync +vsync
    ModeLine     "1792x1344@60" 204.8 1792 1920 2120 2448 1344 1345 1348 1394 -hsync +vsync
    ModeLine     "1856x1392@60" 218.3 1856 1952 2176 2528 1392 1393 1396 1439 -hsync +vsync
    Option        "VendorName" "ATI Proprietary Driver"
    Option        "ModelName" "Generic Autodetecting Monitor"
    Option        "DPMS" "true"
EndSection

Section "Device"
    Identifier  "Configured Video Device"
EndSection

Section "Device"
    Identifier  "aticonfig-Device[0]-0"
    Driver      "fglrx"
    Option        "EnableMonitor" "crt1,lvds,tv,tmds1,crt2,tmds2,cv,tmds2i"
    BusID       "PCI:1:0:0"
EndSection

Section "Screen"
    Identifier "Default Screen"
    Device     "Configured Video Device"
    Monitor    "Configured Monitor"
EndSection

Section "Screen"
    Identifier "aticonfig-Screen[0]-0"
    Device     "aticonfig-Device[0]-0"
    Monitor    "aticonfig-Monitor[0]-0"
    DefaultDepth     24
    SubSection "Display"
        Viewport   0 0
        Virtual   1920 1080
        Depth     24
        Modes    "1920x1080@60" "1920x1080@75" "1152x864@75" "1152x864@60" "1280x1024@75" "1280x1024@60" "1024x768@75" "1024x768@60" "1280x960@75" "1024x960@60" "800x600@75" "800x600@60" "1400x1050@60" "1400x1050@75" "1600x1200@75" "1600x1200@60" "640x480@75" "640x480@60"
    EndSubSection
EndSection

Sirius Lux による投稿:

参考になったものとしては
https://forums.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=6280
を参考にさせていただきました
前にも書いたようにrun形式のままのドライバだとインストールできません。
そのためdebパッケージ化して入れているのですがxorg.confの変化もなくローグラフィックモードできどうさせられるようです。
そして先ほど書いたアドレスのドライバのだとインストーラーがしっかり起動してくれます。

私のコードをそのままコピペしてもあなたの環境では正常に動作しないと思います。
それはなぜかと言うと使っている環境が違うからです。
もっと砕けた状態で言うと私の場合は、Radeon HD4650というグラフィックカードを使用している為に貴方の示したリンク先のドライバーでも適応が可能なのだと思います。
でも実際には、私は前スレで示したオフィシャルのサイトからダウンロードして導入しました。
では、どうすればよいのかと言えば適切なドライバーを使うしかありません。
リンク先は下記を参考にして下さい（前に貼ったものと同じです）
http://support.amd.com/us/gpudownload/linux/Legacy/Pages/radeon_linux.aspx?type=2.7&product=2.7.4.3.3.3.1&lang=English

あるいは、人柱バージョンを使うかの何れかだと思います。
最悪、古いバージョンのUbuntuを使ってみると上手く当たるかもしれません。

Sirius Lux による投稿:

また「人柱バージョン」とはどのようなものでしょうか？

ハードウェア・ドライバでヒットしたドライバーのことでUbuntuのサーバーにアップされているものです。
「debパッケージ」はあらかじめパッケージマネージャからミラーサーバーよりダウンロードし容易にインストールが出来るようになっているのでユーザー側でビルドしなくてもよいのです。ただ、このパッケージのドライバーだと上手くあたるかどうか試してみないことには分かりません。　また、別の意味で人柱バージョンのことを解説するとFierfoxやOpenOfficeなどを立ち上げた時にヘルプメニューから「Mozilla Firefoxについて」や「OpenOffice.org情報」と言うところを見てください。
すると、デストリの名前が書いてあったりパッケージの名前が入っていたりします。
これは、このデストリに合わせて少し手を加えてますよと言う意味だそうです。
結局、フリーウェアーについてはソースが公開されているので手直しが自由に出来るということらしいです。
そういうことから訳の分からないパッケージを導入するのではなく、synapticパッケージマネージャからアプリケーションを導入したほうが、そのデストリには上手く動作するようにチューニングされているので安心して使えるというわけです。
ただ、ATIのドライバーについてはメーカー供給なのでソースを弄ることが出来ません。
その代わりに、Ubuntuの開発者が予めテストに成功したものを公開しているということだそうです。
ですから、開発者の環境では動いたけどユーザー側の環境で上手く動作するかということに関しては、試してみないことには判らないといったところだろうと思います。

結論からいうと自分の環境にあった適切なバージョンのドライバーを当てて下さい。
また、OSの使用しているカーネルに依存している場合も考えられますので旧バージョンのOSに乗り換えることもご検討下さい。



koisan1949さん
お久しぶりです。
いろいろとフォローして下さり有難うございました。
今、8.04を使われているのですね。
このころだとまだxsever-xglをあてていたころでしたっけ？
それからすると随分楽になりましたよね。
因みに、私のほうは、9.10を使っております。
開発バージョンだけに山あり谷ありです=)

Sirius Lux による投稿:

ところが起動時にローグラフィックモードで起動しろみたいな感じのメニューが出てきたので素直に起動しました。

こちらで#1の状況を再現してみたところオフィシャルのドライバーをインストールした後にXの起動がおかしくなるようですね。
ご報告にもある通りローグラフィックモードかあるいはテキストモードへの移行を促す画面も出てきました。
そこで、とりあえず最上部を選択するとGUIでログイン画面が立ち上がりデスクトップもたちあがりました。
このままでは、Xの起動が不安定なので手を加えてみました。

1.管理者権限でファイルマネージャを起動する
   $ sudo nautilus

2.立ち上がったファイルマネージャより /etc/x11 と進む

3.開いたディレクトリーの中にある　xorg.conf　という名前のついたファイルの中で　xorg.conf.failsafe　だけを残しそれ以外は削除する。（結局、xorg.conf.failsafe　が標準の設定ファイルのようです。下記のコードを参照して下さい。）

Section "Device"
    Identifier    "Configured Video Device"
    Driver        "vesa"
EndSection

Section "Monitor"
    Identifier    "Configured Monitor"
EndSection

Section "Screen"
    Identifier    "Default Screen"
    Monitor        "Configured Monitor"
    Device        "Configured Video Device"
EndSection

4.各ファイルを削除後に再起動すると正常にXが起動します。

5.ログイン成功後にデスクトップが正常に起動したら「システム」→「システム管理」→「ハードウェアー・ドライバー」より
　人柱バージョンのドライバーをインストールする。ドライバーのインストールに成功したら再起動する。

6.システムの再起動後に「外観の設定」から「追加効果」で3Dデスクトップが使用可能になると思います。
　復旧後の xorg.con は下記の通りです。

Section "Monitor"
    Identifier   "aticonfig-Monitor[0]-0"
    Option        "VendorName" "ATI Proprietary Driver"
    Option        "ModelName" "Generic Autodetecting Monitor"
    Option        "DPMS" "true"
EndSection

Section "Screen"
    Identifier "aticonfig-Screen[0]-0"
    Device     "aticonfig-Device[0]-0"
    Monitor    "aticonfig-Monitor[0]-0"
    DefaultDepth    24
    SubSection "Display"
        Viewport   0 0
        Depth     24
    EndSubSection
EndSection

Section "Module"
    Load    "glx"
EndSection

Section "ServerLayout"
    Identifier     "aticonfig Layout"
    Screen      0  "aticonfig-Screen[0]-0" 0 0
EndSection

Section "Device"
    Identifier  "aticonfig-Device[0]-0"
    BusID       "PCI:1:0:0"
    Driver    "fglrx"
EndSection

私の環境では以上の操作で復旧しました。
カーネルが2.6.31-16-genericに更新されたあたりからオフィシャルのドライバーが動作不安定になったのは、これが原因だったのかもしれませんね。とりあえず人柱バージョンのドライバーが上手く動作するようでしたら、こちらを使用することをお勧めいたします。因みに、9.04や前のカーネルだとオフィシャルのドライバーのほうが上手く動作してくれます。これについては、実証済みです。
尚、この公開した操作については、Sirius Luxさんのご使用の環境とは違うので、もしかしたら上手く行かないかも知れませんが、ご質問の解決において参考になれば幸です。=)

Sirius Lux による投稿:

人柱バージョンは
xorg-driver-fglrx
fglrx-amdcccle
fglrx-kernel-source
の3つですか？

こちらの現状で申しますとご指摘にあります3つのパッケージが有効になっています。
とりあえず、不要なファイルを削除したあとで＃22の手順5の要領で「ハードウェアー・ドライバー」でヒットしたパッケージをあてて下さい。そのドライバーが上手くあたれば動作してくれると思います。
もし駄目なら8.04LTSバージョンのUbuntuを試して下さい。