いまだ解決がつかない状態で大変困っております。
以下の結果を踏まえて、「SiI 3512 [SATALink/SATARaid] Serial ATA Controller,kernel 2.6.31,ubuntu」などで
検索をして解決を図ろうとしましたが、よくわからなかったです。

kernel 2.6.28-11-genericではHDDが認識されて、自動マウントされます。
esataのPCカードREXーCB１５Sは正常に動作しています。
自動マウントされたときの結果です。
#lshw
     *-storage
          description: Mass storage controller
          product: SiI 3512 [SATALink/SATARaid] Serial ATA Controller
          vendor: Silicon Image, Inc.
          physical id: 2
          bus info: pci@0000:06:00.0
          logical name: scsi5
          version: 01
          width: 32 bits
          clock: 66MHz
          capabilities: storage pm bus_master cap_list rom emulated
          configuration: driver=sata_sil latency=64
          resources: irq:16 ioport:4010(size=8) ioport:4020(size=4) ioport:4018(size=8) ioport:4024(size=4) ioport:4000(size=16) memory:c4000000-c40001ff memory:d8000000-d807ffff(prefetchable)
        *-disk
             description: ATA Disk
             product: Hitachi HTS54121
             vendor: Hitachi
             physical id: 0.0.0
             bus info: scsi@5:0.0.0
             logical name: /dev/sdb
             version: HP4O
             serial: HP2400BEGNZ7VA
             size: 111GiB (120GB)
             capabilities: partitioned partitioned:dos
             configuration: ansiversion=5 signature=786166ae
           *-volume
                description: Windows NTFS volume
                physical id: 1
                bus info: scsi@5:0.0.0,1
                logical name: /dev/sdb1
                logical name: /media/92BAF48FBAF470D9
                version: 3.1
                serial: 3af0a495-34d6-d945-bdf0-d7a3f1cd5e70
                size: 111GiB
                capacity: 111GiB
                capabilities: primary ntfs initialized
                configuration: clustersize=512 created=2007-09-24 22:22:21 filesystem=ntfs mount.fstype=fuseblk mount.options=rw,nosuid,nodev,user_id=0,group_id=0,default_permissions,allow_other state=mounted

ところが、kernel 2.6.31-17-generic
で起動しますと、以下のような結果になってしまいます。
    *-storage
          description: Mass storage controller
          product: SiI 3512 [SATALink/SATARaid] Serial ATA Controller
          vendor: Silicon Image, Inc.
          physical id: 2
          bus info: pci@0000:06:00.0
          version: 01
          width: 32 bits
          clock: 66MHz
          capabilities: storage pm bus_master cap_list rom
          configuration: driver=sata_sil latency=64
          resources: irq:16 ioport:4010(size=8) ioport:4020(size=4) ioport:4018(size=8) ioport:4024(size=4) ioport:4000(size=16) memory:c0000000-c00001ff memory:d8000000-d807ffff(prefetchable)
*-disk と*-volumeが出ませんので、外付けHDDが認識されていません。
dmesgの結果は、最初に質問させていただいたとおり、
「EH complete」で止まってしまいます。
これは、もはや諦めたほうがよいでしょうか。
アドヴァイスをお願い致します。またアドヴァイスをいただくためには、どのような結果をあげていくべきか、
お教えいただけるとこれからの勉強になります。

sata_silは組み込みでした。
#3は無視してください。