upick さん 早速の回答ありがとうございました。　バックアップのチェックを外すことでチルダ付きのHTMLファイルの作成を防ぐことができました。　一斉削除については「アプリ」「アクセサリ」「端末」で出てくる画面だろうと思いますが、 rm * の次は ~ でしょうか。　回答に示された記号とは違うようなので。　また、フォルダ名かファイル名を記入する必要がありますか。　とりあえず、以前にチルダ付きファイルを削除しておいたフォルダをコピーして修正作業をしています。

#1のonedogさんへ

onedog による投稿:

１： ネットで”KFTPGrabberの使い方”で検索したら Linux Salad というブログがあり、このクライアントの説明をを見つけましたが、「クイック接続」の「ホスト」欄は私の場合FC2.comとなるのでしょうか。

そこには、任意の接続設定名を記入します。
しかし、クイック接続はURL欄と妙な連動をしている為、私が試用した限りは使いにくいと感じました。
代わりに、[Bookmarks]->[ブックマークを編集]を開き、左のBookmarksの何も無いエリアを右クリック->[新規]として新規設定した方が分かりやすいでしょう。

onedog による投稿:

２：画面に「ローカルセッション」のタブが左右にでます。名前欄に転送するファイルを表示するところまではできるのですが、その先のwebサイトの更新の方法が分かりません。　前記のブログでは、「ファイルやフォルダをドラッグアンドドロップして転送します」となっていますが、意味が分かりません。

まず最初に、右ペイン(onedogさんの言われる「右のタブ」)の足跡アイコン -> [接続] -> [<接続設定名>]でFTPサーバに接続してください。
# FFFTPと違うので戸惑うのも無理はないです。

onedog による投稿:

チルダの付いた HTMLファイルを除外する必要があります。　

KFTPGrabberの設定で、ファイル末尾が~(チルダ)のファイルをリスト表示しないようにすればよいでしょう。

[Settings] -> [Configure KFTPGrabber]を開き、
フィルタのところで
条件に、[以下のいずれかにマッチ] [ファイル名] [正規表現にマッチする]として ~$ と入力
動作に、[リストビューに表示しない]を選択
http://imagebin.org/84735 [14日有効]

あと、初心者が通常運用で慣れないrmコマンドをわざわざ使用することはないでしょう、というのが私の考え方です。(人によって考え方は様々ですが)
代わりに、ファイルブラウザを開き、1)隠しファイルを表示する設定にし、2)一覧表示にし、3)種類列で並び変え、4)複数ファイル選択しファイル削除、で容易に実現できます。
http://imagebin.org/84748 [14日有効]

#6のonedogさん

#6のonedogさん による投稿:

１： の接続設定名は、FC2.comより通知されたホスト名と理解していいでしょうか。

いいえ。「FC2ホームページ」などの任意の文字列です。
任意なので、ホスト名でも別に構いません。

#6のonedogさん による投稿:

２：については、「左のペインの名前欄に目的のフォルダを表示し、右のペインでご教示の方法でFTPサーバに接続する」　ということでいいのでしょうか。　また、この後にWEBサイトに転送するための手順が必要になるのでしょうか。　

はい必要です。Linux Saladaに書いてある通り「ファイルやフォルダをドラッグアンドドロップして転送します」の操作です。

#6のonedogさん による投稿:

お手数でしょうが、最初から最後までの手順を列記していただけると習得出来ると思いますのでよろしくお願い致します。

手取り足取りで説明する気力が私にはないです。ごめんなさい。
まずは適当に操作して、試行錯誤してみてください。

webへの接続と個別ファイルのoverwriteは出来るようになりました。Overwrite Allが一括書き換えかと思いましたがこれはできませんでした。取り合えずこれで一つずつ書き換えをおこなっています。(OneDog)