inkscape のバグのようです。
https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/inkscape/+bug/406036
Ubuntu だけでなく他の Linux や Windows でも発生しているようです。

調べたところ、下記のようなページが見つかって試してみたのですが、私の所では効果がありませんでした。
http://d.hatena.ne.jp/kariostro/20091109/1257772266

僕はあるソフトをコンパイルするためにGTKのライブラリをインストールしたのですが、それが原因ということは考えられますか？それが原因ならすっきりするのですが。

わたしも使っているので,気になりました.
参考になるか判りませんが,ちょっと手元の環境で再現するか試してみました

Ubuntu 8.04 LTS + Inkscape 0.46 (scim-anthy-1.2.7) → 問題無し 日本語入力出来る
Ubuntu 9.04       + Inkscape 0.46 (scim-anthy-1.2.7) → 問題無し 日本語入力出来る
Windows XP Home(SP3) + Inkscape 0.47 (Atok 14)    → 問題無し 日本語入力出来る

最新安定版は,0.47です.(Windows版のアーカイブ名には,inkscape-0.47-3.exeとある.)

8.04LTS/9.04は,一つ前のバージョンで,scim-anthyも同じなので,この組み合わせは大丈夫そうです.
たぶん,9.10に採用されているのは,0.47なのでしょうけれど,Windows版では再現していません.
Windows版は本家Inkscape.orgからもって来ているので,もう対策済みなのかも知れません.
(修正が入ってるから"-3"なのかも…)

自己レスです。
原因を究明したいと暇を見つけ、インストールを繰り返しながら確認をしました。使えていたのが急に使えなくなりますね。昨日、新規にインストールし使えることを確認し、今朝、使うと落ちます。残念。教えていただいた以下の方法で、落ちません。でも日本語の入力ができないので困った。

http://d.hatena.ne.jp/kariostro/20091109/1257772266

ベクターグラフィックを作成する、inkscapeの代替ソフトは何が良いでしょうか？

Macは昔から使っており、MacDrawで色々、図版を書いていました。最近はMacDrawが無いので、困っております。仕方ないのでPagesを使っていますが。ここが解決できるとUbuntuで論文を作成できるのですが。

koji.takemasa による投稿:

ベクターグラフィックを作成する、inkscapeの代替ソフトは何が良いでしょうか？

私が試した、Ubuntuで、日本語入力が使えるベクターグラフィックを扱えるアプリは「Dia」と「OpenOffice.org Draw」ぐらいの様です。

私は gedit で入力したものをコピペしているのですが、それではダメですか？

そもそもinkscapeで日本語入力できないのか?を私の環境で確認していなかったのでやってみました。
Kubuntu 9.10(amd64)

$ apt-cache policy inkscape
inkscape:
  インストールされているバージョン: 0.47~pre4-0ubuntu1
  候補: 0.47~pre4-0ubuntu1
  バージョンテーブル:
 *** 0.47~pre4-0ubuntu1 0
        500 http://ubuntu.mithril-linux.org karmic/main Packages
        100 /var/lib/dpkg/status

で日本語入力できるようです。
ただ、今、インストールして確認しただけなので、なにかのきっかけで異常が発生するという類の話だと検証が十分でないかも知れません。

ubuntu, DTPでぐぐると、
Xara Xtreme
scribus
などが見つかりました。日本語入力がデフォルトで可能かは調べていません。

WYSIWYGにこだわりがなければ、絵やグラフだけ他のソフトで作ってpLaTeXというのも有りかな、と思います。