PCは条件が揃うと指定のプログラム（スクリーンセーバー）を実行するコマンドを送ります。
プログラムは画像であったりアニメーションで有ったりと自由ですのでflashをそのままスクリーンセーバーにするのではなくて、flashを使用したスクリーンセーバーを作成する。が正解の気がしますが、なにかしら簡単に作成する便利ソフトは存在するかもしれませんね。

何だか面白そうなので、時間の合間にスクリーンセーバーのソースとネットの情報を見てきます。
もしかしたらusplashの変更トピックの様にswfを差し替えてOKなんて甘いパターンもあるかも。