もうちょっと詳しい情報が欲しいところですが、とりあえず、ログインしてみて、
$ export LANG=C
$ export LANGUAGE=C
$ sudo dpkg-reconfigure -a
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get upgrade
$ sudo tasksel install ubuntu-desktop
$ sudo reboot
で、どうでしょうか。
駄目だった場合は、アップグレード時に、なにかエラーがでなかったか、あるいは、起動途中に何かエラーメッセージものはでていないかなどできるだけ詳しく説明して下さい。

ctrl+alt+F2
と押してテキストコンソールに切り替えて、

$ export LANG=C
$ export LANGUAGE=C
$ sudo dpkg-reconfigure -a
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get upgrade
$ sudo reboot

としてみて下さい。Y/Nの選択肢がでて判断に迷う場合は画面表示をメモして投稿して下さい。

# すいませんが、私は今日はもう返信できないかも知れません。

ありがとうございました。

テキストコンソールに切り替えてもう一度やってみましたが、
特に変わらずでした。

ノートPCなので、ポインタでしか確認していなかったので、
マウスで確認してみます。

いろいろと助かります。

外付けマウスは使えました。
スクロールマウスが動かなく、更にアップグレード後音まで鳴らなくなっていました。

$ less /etc/apt/sources.list
$ ls /etc/apt/sources.list.d/*.list | xargs cat | less
上記コマンドは、1行づつ実行すればよいのでしょうか？

/etc/X11/xorg.conf については、実行しても”Permission denied”と出ます。

$ xinput list を実行したものを以下に添付します
。

"Virtual core pointer" id=0 [XPointer]
Num_buttons is 32
Num_axes is 2
Mode is Relative
Motion_buffer is 256
Axis 0 :
Min_value is -1
Max_value is -1
Resolution is 0
Axis 1 :
Min_value is -1
Max_value is -1
Resolution is 0
"Virtual core keyboard" id=1 [XKeyboard]
Num_keys is 248
Min_keycode is 8
Max_keycode is 255
"AT Translated Set 2 keyboard" id=2 [XExtensionKeyboard]
Type is KEYBOARD
Num_keys is 248
Min_keycode is 8
Max_keycode is 255
"Power Button (CM)" id=3 [XExtensionKeyboard]
Type is KEYBOARD
Num_keys is 248
Min_keycode is 8
Max_keycode is 255
"Sony Vaio Keys" id=4 [XExtensionKeyboard]
Type is KEYBOARD
Num_keys is 248
Min_keycode is 8
Max_keycode is 255
"Video Bus" id=5 [XExtensionKeyboard]
Type is KEYBOARD
Num_keys is 248
Min_keycode is 8

※規約違反により追放されたユーザの投稿は、ログインユーザにのみ表示されます。

まず、こちらと
$ grep jaunty -n /etc/apt/sources.list
$ grep jaunty -n /etc/apt/sources.list.d/*.list
$ grep intrepid -n /etc/apt/sources.list
$ grep intrepid -n /etc/apt/sources.list.d/*.list

こちらの二つを実行しました。しかし、特に出力情報は流れませんでしたが。。
$ grep -v -n ^# /etc/apt/sources.list | grep -v karmic | grep -v ^[0-9]*:$
$ grep -v -n -H ^# /etc/apt/sources.list.d/*.list | grep -v karmic | grep -v [0-9]*:$


$ cat /etc/apt/sources.list
$ ls /etc/apt/sources.list.d/*.list | xargs cat
こちらの出力結果が以下になります。

cat /etc/apt/sources.list
# deb cdrom:[Ubuntu 9.04 _Jaunty Jackalope_ - Release i386 Japanese
Remix (20090424.1)]/ jaunty main restricted
# See http://help.ubuntu.com/community/UpgradeNotes for how to upgrade
to
# newer versions of the distribution.

deb http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic main restricted
deb-src http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic main restricted

## Major bug fix updates produced after the final release of the
## distribution.
deb http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic-updates main restricted
deb-src http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic-updates main
restricted

## N.B. software from this repository is ENTIRELY UNSUPPORTED by the
Ubuntu
## team. Also, please note that software in universe WILL NOT receive
any
## review or updates from the Ubuntu security team.
deb http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic universe
deb-src http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic universe
deb http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic-updates universe
deb-src http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic-updates universe

## N.B. software from this repository is ENTIRELY UNSUPPORTED by the
Ubuntu
## team, and may not be under a free licence. Please satisfy yourself as
to
## your rights to use the software. Also, please note that software in
## multiverse WILL NOT receive any review or updates from the Ubuntu
## security team.
deb http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic multiverse
deb-src http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic multiverse
deb http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic-updates multiverse
deb-src http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ karmic-updates multiverse

## Uncomment the following two lines to add software from the
'backports'
## repository.
## N.B. software from this repository may not have been tested as
## extensively as that contained in the main release, although it
includes
## newer versions of some applications which may provide useful
features.
## Also, please note that software in backports WILL NOT receive any
review
## or updates from the Ubuntu security team.
# deb http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ jaunty-backports main
restricted universe multiverse
# deb-src http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ jaunty-backports main
restricted universe multiverse

## Uncomment the following two lines to add software from Canonical's
## 'partner' repository.
## This software is not part of Ubuntu, but is offered by Canonical and
the
## respective vendors as a service to Ubuntu users.
# deb http://archive.canonical.com/ubuntu jaunty partner
# deb-src http://archive.canonical.com/ubuntu jaunty partner

deb http://security.ubuntu.com/ubuntu karmic-security main restricted
deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu karmic-security main
restricted
deb http://security.ubuntu.com/ubuntu karmic-security universe
deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu karmic-security universe
deb http://security.ubuntu.com/ubuntu karmic-security multiverse
deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu karmic-security multiverse
honda@honda-laptop:~$ ls /etc/apt/sources.list.d/*.list | xargs cat
## Ubuntu Japanese LoCo Team's 3rd party repository for Ubuntu 9.04
## Please report any bug on
https://bugs.launchpad.net/ubuntu-jp-improvement
# deb http://archive.ubuntulinux.jp/ubuntu karmic main # karmicへのアッ
プグレードは無効化されました
# deb http://archive.ubuntulinux.jp/ubuntu-ja jaunty-non-free/ # karmic
へのアップグレードは無効化されました

まずは端末から以下を実施しました。

$ lsb_release -r -c

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get upgrade
$ sudo apt-get dist-upgrade


$ cat /etc/X11/xorg.conf
の出力結果がこちらです。

cat /etc/X11/xorg.conf
> # xorg.conf (X.Org X Window System server configuration file)
> #
> # This file was generated by dexconf, the Debian X Configuration tool,
> using
> # values from the debconf database.
> #
> # Edit this file with caution, and see the xorg.conf manual page.
> # (Type "man xorg.conf" at the shell prompt.)
> #
> # This file is automatically updated on xserver-xorg package upgrades
> *only*
> # if it has not been modified since the last upgrade of the xserver-xorg
> # package.
> #
> # Note that some configuration settings that could be done previously
> # in this file, now are automatically configured by the server and
> settings
> # here are ignored.
> #
> # If you have edited this file but would like it to be automatically
> updated
> # again, run the following command:
> #   sudo dpkg-reconfigure -phigh xserver-xorg
>
> Section "Device"
> Identifier "Configured Video Device"
> EndSection
>
> Section "Monitor"
> Identifier "Configured Monitor"
> EndSection
>
> Section "Screen"
> Identifier "Default Screen"
> Monitor "Configured Monitor"
> Device "Configured Video Device"
> EndSection

それと、パッケージマネージャでxserver-xorg-input-evdevが入っているかを確認しましたが、
インストール済みバージョンのところが"1:2.2.5-1ubuntu6"になってました。

よろしくお願いします。

うまく表示させられなかった。。
最後3行の部分は、
［code］と、［/code］(を半角ASCIIで書いたもの)
で囲っていただけると見易いです。

の意です。

うーん。関係ありそうなパッケージはインストールされているっぽいですね。。
udevの方でもマウスを検出してるっぽいです。

$ grep -i mouse /var/log/Xorg.0.log

の方の結果はいかがでしたでしょうか。
また、

$ ps aux | grep hal

の結果も併せて投稿願えますでしょうか。
udevで認識されていてxinput listで出ないということはXの段階でなにかエラーが起きている気がします(多分)。

$ grep -i mouse /var/log/udev
は、/var/log/udevというログファイルの中を一行ずつ読み込み、
"mouse"という文字列を含む(-iオプションなので大文字、小文字を区別しません)行を画面に出力する、
というだけのものなのでシステムの動作を変えるようなコマンドではありません。
他に特別な操作をしていないのに、システムの挙動が変わったとのことであれば、ハードウェア的な問題を疑った方がよいのかも。
例えば別のPCでLiveCDやLiveUSBを作成し、そのPCで動作確認をとり、今問題になっているPCに持ってきて正常に動作するか確認することはできますでしょうか。
あるいは今問題になっているPCでデュアルブートにしているOSがあれば、そちらでの動作確認でもよいかと思います。
ハード的な不具合がなさそうであれば、
$ grep 'Mar 19' /var/log/syslog
$ grep 'Mar 19' /var/log/messages
$ less /var/log/Xorg.failsafe.log
$ less /var/log/Xorg.0.log
などとしてなにかエラーログが残っていないか確認してみて下さい。
'Mar 19'は今日の日付ですが、適宜変更願います。
また、Xorgのログについては、特に最後の部分でエラーを起こして異常終了していないか確認してみて下さい。

妙ですね。なにが原因でシステムの挙動が変わってしまったのでしょう。
なにか心当たりはありませんでしょうか。

とりあえず、CUIではログインできる状態だと思いますので、ログインしてみて、
$ export LANG=C
$ export LANGUAGE=C
$ sudo service gdm start
でGUIのログイン画面(gdm)が立ち上がるか確認してみて下さい。
もし、すでに起動していたら、
$ sudo service gdm restart
してみて下さい。
それでも起動しない場合は、alt+ctrl+F7を押してみて下さい。
全て試してもGUIのログイン画面が起動しない場合、上記コマンドを実行したときの画面表示(なんらかのエラーメッセージがでているはずです)を投稿願います。

状態が変わったきっかけだけでも判ればよいのですが。。
なにか心当たりはありませんでしょうか。

$ export LANG=C
$ export LANGUAGE=C
$ sudo startx
で、どこでエラーになっているか表示されると思います。
ログの内容がわからない、見切れない等々ありましたら、
$ sudo startx > startx.log 2>&1
として、内容をファイル(上記例では現在ディレクトリのstartx.logに出力されます)に書き出してみて、それを投稿してみて下さい。
FATでフォーマットされたUSBメモリを挿して、
$ tail /var/log/messages
とすればUSBメモリのデバイス名がわかると思います。仮に/dev/sdbだったとすると
$ sudo mkdir /media/usbmemory
$ sudo mount -t vfat /dev/sdb0 /media/usbmemory
とかすればマウントできたかと思います。
うまくマウントできていれば
$ sudo cp startx.log /media/usbmemory
としてコピーしてください。