必要かもしれませんので、パーティションの情報を追記します。
/dev/sda1 ntfs 100MiB 空き66MiB   フラグboot
/dev/sda2 ntfs 100GIB 空き67GiB  Windowsが入っている。
/dev/sda3 ntfs 831GiB 空き828GiB

/dev/sdb1 ntfs 1.36TB 空き1.08GiB

インストール時は外付けHDDをつけていましたが、ubuntuは内部のHDDに入れたので煩雑になるため現在は外しています。
ubuntuがどこにあるのかは恥ずかしながらわからなくなってしまいました。
sda3に入れたはずですが該当しそうなフォルダが見つけられずにいます。

多分、wubi というプログラムでインストールしたと思います。
私は詳しくないのであまり役に立てません。

wubi ではウィンドウズのファイルシステムに仮想的なディスクを作り
そこに ubuntu をインストールします。
ブートローダーはウィンドウズのオリジナルのままで、そこに ubuntu の起動メニューを追加します。

ですから、Main Boot Record(MBR) には何も手を加えません。

詳しい方が助けてくれるのを待つのが正解かと。

rin haseさん による投稿:

CDからubuntuを起動し、そこからubuntuのインストールを試み再起動した

もう少し、詳しく手順を説明願います。
具体的に言うと、CDからubuntuを起動というのは、PCの電源投入時からUbuntuのLiveCDを挿入しておいて、LivdCDから起動させて、ということでしょうか。
その場合は、
https://wiki.ubuntulinux.jp/UbuntuTips/Install/InstallUbuntu
の3のような画面がでていたかと思います。これが通常のインストール方法です。

あるいは、Windowsを起動させてから、CD内にあるwubiというインストーラを起動したということでしょうか。
この場合は、通常とは異なったインストール形態となります。

パーティション情報については、どのように確認したものでしょうか。
確認手順を投稿下さい。
このパーティション情報が正しいのであれば、通常の方法ではインストールされていないように見えます。
USB接続HDDにインストールしたりしていないでしょうか。

また、現在、CDを抜いた状態でPCの電源を入れなおすとどのような画面が表示されるでしょうか。
WindowsとUbuntuを選択する画面が表示される場合、できるだけ詳しく見えるものを投稿願います。
選択肢が表示される場合、そこからWindowsやUbuntuが起動できるかも教えて下さい。

なお、WindowsとUbuntuのデュアルブートでのインストールは多少面倒なこともあるので、インストールは一時中断し、どのような手順ですればよいか理解されたうえで再開して下さい。

rin haseさん による投稿:

今外付けHDDをつけて確認したところ、sdi1にlinux Ext4の表示がありました。
これはPalimpsest　ディスクユーティリティで確認できたものです。
インストール先を間違えていたということでしょうか。

どうやらそのようですね。
ただ、そのあとご自身で解決されたとのことで安心致しました。
また、詳細な手順の投稿、ありがとうございます。 :)
このトピックを見ていた方々や、後に、このトピックに開いた方々にも手順(や、留意事項)がよく判り、参考になるかと思います。