ヒントしか言えないことを了解の上で。

comment : root@ubuntu:/etc# cat fstab
unionfs / unionfs rw 0 0
tmpfs /tmp tmpfs nosuid,nodev 0 0
/dev/sdc1 /windows (FAT32) ro 0 0

こんな風にインストール前にマウント方法を確定させておけば
リードオンリーになるはずなんだけどー

参考スレ　（FAT32でマウントしようとするのをEXT2で確定させる）
http://forum.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=10

同じ現象に遭遇したので報告しときます。

インストールはubuntu-ja-6.10-desktop-i386.isoを起動してデスクトップのアイコンクリックでubiquityを動かしました。
インストールしたPCのhda1はFAT32でWindowsXPが入ってます。

インストール前後に何も特別なことは行わず、終了後すぐ再起動したときに、FAT32のhda1対象にｆｓｃｋが走りました。
その結果、
> 1台目HDDのWindowsパーティション(FAT16/FAT32)の特定の日本語ファイル名が
> "FSKC0000.REN" のようにリネームされてしまいます。
ということになりました。

起動後fstabを見てみたらhda1のエントリはこうなってました。

　# /dev/hda1
　UUID=147D-5829  /media/hda1     vfat    defaults,utf8,umask=007,gid=46 0       1

デフォルトで FAT32 対象に fsck が走る設定になっているのはいかがなものでしょうか。
/lib/partman/fstab.d/basicを覗いてみたら、日本語版に限らず　ubuntu-6.10-desktop-i386.isoでも
同じ結果になるみたいです。

なお、うちで名前が変わってしまったファイルですが、WindowsXP自体に含まれるものとしては

C:\WINDOWS\fsck0000.ren　---> サポテック織り.bmp
C:\Documents and Settings\All Users\スタート メニュー\プログラム\ゲーム\fsck0000.ren
                                     ---> sol.exe（ソリティア）へのショートカットらしい。ファイル名不明。
C:\Documents and Settings\All Users\スタート メニュー\プログラム\管理ツール\fsck0000.ren
                                     ---> comexp.msc(コンポーネント サービス)へのショートカットらしい。ファイル名不明。
の３つだけ。後はアプリケーション関連のファイル/ディレクトリが100個ほど。少しだけ例をあげると、

C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Categories\02ビジネス文書（社外）\fsck0000.ren\fsck0000.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Categories\02ビジネス文書（社外）\fsck0001.ren\fsck0000.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Categories\03ビジネス文書（社内）\02社内の通知・通達・案内\fsck0000.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Categories\03ビジネス文書（社内）\02社内の通知・通達・案内\fsck0001.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Categories\03ビジネス文書（社内）\fsck0000.ren\fsck0000.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Categories\03ビジネス文書（社内）\fsck0001.ren\fsck0000.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0000.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0001.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0002.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0003.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0004.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0005.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0006.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0007.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0008.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0009.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0010.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0011.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0012.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0013.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0014.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0015.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0016.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0017.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0018.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0019.ren
C:\Program Files\Creoapp\Mamew15\Picture\01年賀状\04写真\03その他干支\fsck0020.ren
C:\Program Files\Adobe\Photoshop Elements 2\プラグイン\フィルタ\fsck0000.ren
C:\Program Files\Adobe\Photoshop Elements 2\プラグイン\フィルタ\ライティングスタイル\fsck0000.ren
C:\Program Files\Adobe\Photoshop Elements 2\プラグイン\フィルタ\ライティングスタイル\fsck0001.ren
C:\Program Files\Adobe\Photoshop Elements 2\プラグイン\効果\fsck0000.ren
C:\Program Files\Adobe\Photoshop Elements 2\プリセット\スタイル\fsck0000.ren
C:\Program Files\Adobe\Photoshop Elements 2\プレビュー\フィルタ\fsck0000.ren\fsck0000.ren
C:\Program Files\Adobe\Photoshop Elements 2\プレビュー\フィルタ\fsck0000.ren\fsck0001.ren
C:\Program Files\Adobe\Photoshop Elements 2\プレビュー\フィルタ\アーティスティック\fsck0000.ren
C:\Program Files\Adobe\Photoshop Elements 2\プレビュー\効果\画像エフェクト\fsck0001.ren