システム　→　設定　から　外観の設定を開き「テーマ」タブの右下にある「インストール」をクリック。
ダウンロードしたテーマを指定して下さい。
追加されたテーマがメインウィンドに表示されると思います（その後、更にクリックで指定しなければいけないかも）

追記です。
それでWindowの色が変えれるんですか？

もう一つゴメン。。。

スポイトのアイコンをクリックして好きな色の上でクリックすると色の値が取得できます。

あのー、質問しといて失礼ですが、Windowの背景ではなく、Windowを開くと、例えば、このサイトを見ていると、Windowの一番上に「Ubuntu日本語フォーラム／Windowについて-MozillaFirefox」と出ていますよね、その部分の色を変えたいんですけど。
僕の質問の仕方が悪くてすいません。

確実なのはテーマパッケージを展開して、中身を好みの形に修正し、外観の設定からインストールして、使うことです。
その場合は、オリジナルのテーマのライセンスをよく読んで、義務・制限についてよく理解願います。