Diskの認識という意味では、PC(のM/B)的に問題無く認識できるものであれば、Ubuntu側からは問題無く認識できると思われます。
ただし、Vineは5.0より前のものはEUC-JPが標準文字コードであったため、場合によってはconvmvなどを使って文字コード変換しないといけないかも知れません。
また、ファイルの内容も、場合によっては文字コード変換が必要になるケースがあります。
自分がVineからUbuntuに切り替えたのが2年近く前のため、曖昧な記憶となってしまいますが、thunderbirdのディレクトリ名などが文字化けしたような気がします(数が少なかったので手修正しました)。