実はIt works.と記述されたhtmlファイルがあり、それが表示されています。
場所は「/var/www」です。デフォルトでは書き込み権限がないので、管理者権限で書き込むか、ディレクトリの所有者を自分にしてください。

アップロード・ダウンロードはftpやsambaではなく、PHPを使ってWebブラウザの画面から行うという手もあります。
通常のUbuntuサーバーなら、PHPはインストール済みだったと思います。<?php phpinfo(); ?>と記述したphpファイルを/var/wwwに置くことで、動作確認できます。
もしPHPがインストールされていないのであれば、php5というパッケージをインストールしてください。apacheとの関連づけなども自動でやってくれます。
FTPを使いたいのであれば、pure-ftpdなどのパッケージがあります。
sambaはsambaというパッケージをインストールすることで利用できます。

構成は人それぞれなので、自分の構成を検討してからそれぞれのソフトの説明を検索するのがいいと思います。
例えばGoogleで「ubuntu apache」や「ubuntu pure-ftpd」と検索するだけでも、分かりやすい説明が多数ヒットします。

初めてサーバーを立てるのであれば、デスクトップ版Ubuntuにapacheやftpd、phpなどをインストールし、GUI操作で設定方法を充分に把握してからサーバー版を使うのがお勧めです。

回答ありがとうございます。昨年(2009年）に刊行された雑誌体の解説本である「Ubuntuで作るLinuxサーバー」(日経Linux編)を取り寄せてみました。内容を見てみると、全210ページ中、サーバ版オンリーの解説記事は最後の3ページのみでありました。ただ、サーバの設定と言う面ではかなりの部分はデスクトップ版とサーバ版で重複するのだろうと思います。

ひとつ分からないことですが、このサーバから別のntpサーバに時間を問い合わせたいと思いますが、記述がないので設定の仕方を教えて頂きたいのですが。
デスクトップ版だったらGUIをカンで操作してたどりつくことができると思いますが。
/etc/ntp.confをエディットしてntpサーバを指定して、そのあとでsudo ntp enable コマンドを入力するというような類だと思いますが、具体的な設定が分かりません（前述は全くのデタラメです）。
よろしくお願いします。

sudo apt-get install ntp してください。
デフォルトでserverとしてntp.ubuntu.comが利用された状態でNTPdが走ります。

同期するサーバを変更する場合は、/etc/ntp.confのserver行を追加・変更してください。