Ubuntu Jpanese Team の Ubuntu Tipsには「USBデバイスへのインストール」方法として
２つの環境を提案されています。

(1)USB スタートアップ・ディスクを作成するには
USBメディアをLive CDと同じ扱いが出来るようにするための作業を紹介した物です。
CDとの違いは一度起動に成功するとそのPCの動作環境を保持できる領域を持てることです。
但し、kernelのバージョンアップは出来ません。
USBの記憶容量4GB以下の小容量のものに適しています。

(2)Ubuntu をUSBストレージ（USBメモリ・HDDなど）にインストールするには
通常HDDにUbuntuをインストールするのと同じです。

今回の場合(1)を実行しようとされている訳ですがCDの読み取りエラーか
USBメディアの読み／書きエラーが出ている用に見受けられます。
直接的な障害解消の提案になっていませんが16GBの容量をお持ちですので
(2)の方法でインストールされるのをお勧めします。