CPU占有を避ける方法はいくつかあるかも知れませんが、スリープ関数などを入れてプログラムを一瞬停止させる方法が、OSに限らず簡単だと思います。

例えば、以下は無限ループですが、CPUの使用率はほとんど上がりません。

while(1)
{
    usleep(1);  // 1マイクロ秒スリープ
}

Windowsで行儀のいいライブラリは待ち合わせ中に適切な頻度でメッセージをディスパッチすべきという作法の話かと思います。これはメッセージを処理するスレッドが待ち合わせのために長時間CPUを占有するとウィンドウの再描画などまで滞ってしまう、などの危惧をしてのことかと思います。そしてそのような処理(作法)はWindows固有のものです。

Windowsでも正確にはメッセージのディスパッチが必要なのはGDIのライブラリを使用する場合だけのはずですが、それがあまりに一般的に使用されるものなので、行儀のいいプログラム/ライブラリでは適切な頻度でディスパッチ処理を暗黙のうちにやっておくべきと認識されています。しかしLinuxでは特別共通に使用されるライブラリはないので、暗黙のうちに必要となる処理はないと思います。強いて似たような処理をあげればシグナル回りくらいですが、waitの際に注意するような話ではありません。

あまり詳しくないので間違っていたらすみません。