変更＊
sudo apt-get update をしたら，パッケージマネージャとかではこの様なメッセージが表示されるようになりました。
--synaptic--
E: 読み込みエラー - read (5: Input/output error)
E: パッケージリストまたは状態ファイルを解析または開くことができませんでした
E: _cache->open() failed, please report.

--アップデート・マネージャー--
パッケージ情報の初期化中に解決できない問題が発生しました。

'update-manager'パッケージのバグとして、以下のエラーメッセージを含めてレポートしてください:

'E:読み込みエラー - read (5: Input/output error), E:パッケージリストまたはステータスファイルを解釈またはオープンすることができません。'


ーー端末でsudo apt-get autoremoveするとーー
xxx@xxx:~$ sudo apt-get autoremove
パッケージリストを読み込んでいます... エラー!
E: 読み込みエラー - read (5: Input/output error)
E: パッケージリストまたはステータスファイルを解釈またはオープンすることができません。

いえ、大丈夫ではないです。
「/etc/apt/sources.list」をリネームしてしまうと、パッケージの更新情報や更新パッケージのダウンロードもできなくなってしまいます。セキュリティフィックスな更新もできませんので、これはよろしくないです。
なので、それは元に戻していただきたいのですが…、正直なところエラーの内容から回復可能なレベルにあるのかどうかすらも私にはわかりませんので、改善案までは出せなかったりします。
全く回答が付かないようでしたら再インストールを覚悟してください。

（「ソフトウェア・ソース」でサーバーを変更したら回復する…なんてことはないかな）

ps. Ubuntuマシンが2台あれば、
姑息ですが、隣から/etc/apt/sources.listをUSBメモリーにコピーして持ってくる手段がありますが。。