自分が持っているものの中で、できるだけ近い環境を、と思って、

[Server]
Ubuntu 10.04 on (Kubuntu 10.04 / VirtualBox)

[Client]
Kubutnu 10.04 (VirtualBoxのHOST)

で試してみましたがごく普通に動いてしまいました。
直接、解決につながるものではありませんが、条件を少しずつ変えながら、どこに問題があるのか切り分けてみてはいかがでしょう。
例えば仮想マシンをVirtualBoxで動かすとどうなるか、とか、Windows7/Macbookにも仮想マシンを導入して、UbuntuのRemoteDesktopClientを使うとどうなるか、とか。
問題箇所が絞り込めれば、対策も考えやすくなるのではないかと思います。

おお。大きな勘違いをしていました(多分)。
Ubuntuでxrdpを動かしているものだとばかり。。

ry による投稿:

castanet さんによる投稿 (#1):

                                              アプリケーション
                                              Ubuntu 10.04
                                              VMWarePlayer
RemoteDesktopClient  <=====>   RemoteDesktopServer
Windows7　　　　　　　　　　　　　　　　　　Windows7
MacBook　　　　　　　　　　　　　　　　　　　PC

この環境でMacBookからRDCを介してPC上のUbuntuアプリケーションを扱うと
アプリケーションのGUIのボタンをクリックしてもマウスカーソルを移動するまでボタンが押されません。
また、端末にキー入力を行ってもマウスカーソルを移動するまでキーが入力されません。

何かのアドバイスがあるわけではありませんが、使用環境を纏めてみました
勘違い等あれがご指摘ください

MacBook にインストールした Windows 7 でリモート デスクトップ クライアントを起動し、別の PC にインストールした Windows 7 のデスクトップを表示
リモート デスクトップ クライアントの中で VMware Pleyer 上の ubuntu 10.04 を操作している
このとき、VMware Pleyer の中の ubuntu 10.04 のアプリケーションのボタンをクリックしても、マウスを移動するまで反応しない

ということでよろしいでしょうか？

そのとおりです。
ボタンが押されないだけではなく、端末（*term）などに文字を入力してもマウスカーソルを移動するまで文字が表示（入力？）されません。

ry による投稿:

何となく ubuntu の問題と言うよりも、リモートデスクトップと VMware Player の組み合わせの問題のような気がします

なぜそのように思われましたか？
もし理由がありましたらご教示ください。

Ubuntu 10.10にアップグレードしたところ、若干症状が改善されました。

Ubuntu 10.04では、文字を入力してもマウスを動かすまで文字が表示されませんでした。
このため、文集を入力するためには、文字を入力し、マウスを動かして文字を確認し、文字を入力し、マウスを動かして文字を確認し、…を繰り返す必要がありました。

Ubuntu 10.10では、何もしなければアクティブなウィンドウに文字を入力することが出来、入力した瞬間に文字が正しく表示されます。
ここまでは、改善されたのですが、
アクティブなウィンドウをマウスでクリックすると、文字が表示されなくなり、次にマウスを動かすまで、その間入力した文字は表示されません。
しかし、マウスを動かした後は、入力した文字がすぐに表示されるようになったので、連続して文章を入力するときのストレスはほとんどなくなりました。
（それでも、この後、またウィンドウをクリックすると、やはりまた文字が表示されなくなります。。）

実用上の問題はだいぶ改善されたのですが、もう少し改善されると嬉しいですね。