C言語ですが、以下にサンプルになりそうなコードがあります。
http://www.linuxquestions.org/questions/linux-newbie-8/how-do-i-read-and-write-to-dev-ttyusb0-in-c-675382/

まず、sttyコマンドで通信の設定をし、デバイスファイル(例:/dev/ttyUSB0)に書き込んだり、デバイスファイルから読み込んだりしています。

fatcatです。

私も同様のこと（PCと機器を接続している状態で、機器から送信されるデータをPCで取得する）を
今行っておりますが参考にしたのは以下のサイトです。

http://www.linux.or.jp/JF/JFdocs/Serial-HOWTO.html
http://www.linux.or.jp/JF/JFdocs/Serial-Programming-HOWTO.html

上記URLの内容もvbkさんがおっしゃっているように
通信の設定を行い、デバイスファイル(/dev/ttyS0など)に書き込んだり、デバイスファイルから読み込んだりしています。

大変申し訳ございませんが
GUIについては何が適切か判断しかねます。