homeのファイルを動かすのにsudoは必要ないです。

> homeフォルダをバックアップしようと、sudoでcp、ddなどのコマンドを実行
よく解りませんが...
少なくとも、ddでは、遣りたいことはできないと思う。

＞ .から始まる名前のフォルダやファイルをコピーすることは出来ないのでしょうか？
$ cp --help とか man cp  とかで、説明が出ます。

また、ファイルブラウザ（nautilus）のメニュー「編集」-「設定」-「表示」-「隠しファイル...」
でドットファイルの表示、コピー等できます（変更を有効にするには、ファイルブラウザの再起動必要）。

ただし、バックアップの送り先により、やり方、使うコマンドは変わる。

macitis による投稿:

homeフォルダをバックアップしようと、sudoでcp、ddなどのコマンドを実行してみましたが、
operation not permittedというエラーを吐き出して止まってしまいます。
(中略)
.から始まる名前のフォルダやファイルをコピーすることは出来ないのでしょうか？
可能ならばその方法を教えて下さい。

ユーザーのホームをバックアップするだけなら, anoirさんのゆーとーり sudoを使うことは無いはずです。
どんなコマンドを打ち込んだんでしょーか ?
バックアップ先は何処ですか ?

もしかして, バックアップ先を Read Onlyでマウントしてませんか ?
(それだと いかに sudoであってもダメな訳だし)

解決(？)しました。

si による投稿:

また、ファイルブラウザ（nautilus）のメニュー「編集」-「設定」-「表示」-「隠しファイル...」
でドットファイルの表示、コピー等できます（変更を有効にするには、ファイルブラウザの再起動必要）。

Thunarで[表示]-[隠しファイルを表示]にチェックをいれ、何度か試してみたところ、
/home/Desktop
をコピーしなければ、
/home/.blender
/home/.wine
以下の一部のファイルがコピー出来ないだけで、必要なデータ(.jd/hoge/hoge.datなど)はコピーできたので良しとします。

皆様ありがとうございました。