投稿者です．

返事をありがとうございます．「やてふ」の文字は表記されているため，
yatexは起動しているようでした．
その後に調べてみたところ，ショートカットの方式が以前の方式から代わり，
Ctrl^c - に続く次のキーにもCtrl^ が必要となっていました．

例：latexによるコンパイルのショートカット
（旧）Ctrl^c - t - j
（新）Ctrl^c - Ctrl^t - j

使えなくなっていたわけではなかったため，自分の勘違いでお騒がせしてしまいましたが，
キーバインドの方式が上記のように若干変更されていたため報告させていただきます．

なんか，環境によっては上のは効きませんでした．
(setq YaTeX-inhibit-prefix-letter nil)
だとどこでもできるみたいです．