幾つか方法があるようですが、体感的に早いと感じられるようになるかどうかは不明です。

1) DMA転送がONになってるか？
　　hdparmコマンドを使用する。　ITメディア-ハードディスクのアクセスが遅いような気がする

2) メインメモリを大盛りにする。

3) CPUを高速なものに取り替える。