cindyさん による投稿:

システム->システム管理->synapticとすると、
　管理者のパスワードを入れる画面が現れて、入れてやるとその画面は消えて、そのままです。
#sudo synapticといれてやると、
　synapticが立ち上がります。

パーミッションが不適切になっているのだと思います。
もしかしたらsynaptic以外の他のメニューでも、同様に正常に動作しないのではないですか。。。
原因としては、以前の/homeを存続させて、新にUbuntu10.10serverを導入しませんでしたか
$ alacarte
　これは、メイン・メニューの操作をコマンドで行う場合です。これでエラーが出たら、想定した内容と合致します。
　(システム　→　設定　→　メイン・メニュー　のことです。)　エラーの内容をcopy&pastして、提示してください。

これらを前提条件として、次のコマンドの結果を提示してください。
~$ ls -l ~/.local/share/applications
こちらも、どうなっていますか。
~$ sudo -s
~# ls -l /root/.local/share/applications
~# exit

$ alacarteとやるとメインメニューがてできます。
$ sudo apt-get install xorg
とするとすでに最新版がはいっていると言ってきました。

管理者のパスワードを入れる画面が現れて、入れてやるとその画面は消えて、そのままです。

これは、パスワード認証が拒否されている状況のようです。
管理者（root）にパスワードを設定していますか。

server 版からデスクトップ環境を入れても root としてログインできなかったと思いますが、
その辺をいじられていますか。

管理者のパスワードではなく、ログインユーザーのパスワードで認証されると思います。

gksu　synapticとやるとパスワードを聞いてきますが、その画面が少し変なのです。それで再インストールしても、そのままです。多分updateとかupgradeの時入れ替わるのでそのまま待つことにしました。

$sudo gconf-editor
として画面が立ち上がって
/apps/gksu/sudo-modeにチエックを入れてます。
再起動してGUIのsynapticをclickしても、また同じ画面が出てきてしまいます。

ただ
$gksu -S synaptic
$gksudo synaptic

とすると、チャントした画面が立ち上がってきます。GUIのプロパティのコマンドを変更すれば良いのでしょうが。

うまくいきました。信じられない!