お騒がせしました．
無事に解決することができました．

audaciousを完全削除して再インストールしても，だめでした．
/~/.config/audaciousを削除して，audaciousを再インストールしてもだめでした．

半ばあきらめていましたが，Ubuntu Tweak！
これを使うことで解決できました．

なぜか，フォルダの関連づけがaudaciousになってしまっていたので，「フォルダを開く」に
設定し直したところ，正常動作に戻すことができました．
関連づけを簡単に編集できて，Ubuntu Tweakは本当にありがたいです．

お騒がせしてすみませんでした．