SSDとHDDを取り付けた状態で、LiveCD(UbuntuのインストールCDでお試しモード)で起動して、「アプリケーション」->「アクセサリ」->「端末」と開いて、以下をコピー＆ペーストしてエンターキーを押してください。

fdisk -lu

結果を貼り付けると回答が得られるかもしれません。
また、SSDとHDDのインターフェイスは何でしょうか？
BIOS上ではどのように認識してるのでしょうか。

早速のご返答、ありがとうございます。

まず、コマンドを入力した結果は以下のようになりました。
いろいろ繋いでいるので非常に長いですが…

Disk /dev/sda: 64.0 GB, 64023257088 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 7783 cylinders, total 125045424 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0x9a03b7c9

   Device Boot      Start         End      Blocks   Id  System
/dev/sda1   *          63   125017829    62508883+   7  HPFS/NTFS

Disk /dev/sdb: 1500.3 GB, 1500301910016 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 182401 cylinders, total 2930277168 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0xbee8bee8

   Device Boot      Start         End      Blocks   Id  System
/dev/sdb1              63  2930272064  1465136001    7  HPFS/NTFS

Disk /dev/sdc: 250.1 GB, 250059350016 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 30401 cylinders, total 488397168 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0x248ea460

   Device Boot      Start         End      Blocks   Id  System
/dev/sdc1              63   488392064   244196001    c  W95 FAT32 (LBA)

Disk /dev/sdf: 1500.3 GB, 1500301910016 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 182401 cylinders, total 2930277168 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0x047cde9b

   Device Boot      Start         End      Blocks   Id  System
/dev/sdf1           16065  2930272064  1465128000    f  W95 Ext'd (LBA)
/dev/sdf5           16128  2930272064  1465127968+   7  HPFS/NTFS

Disk /dev/sdg: 203.9 GB, 203928109056 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 24792 cylinders, total 398297088 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0xfc9afc9a

   Device Boot      Start         End      Blocks   Id  System
/dev/sdg1   *          63   102398309    51199123+   7  HPFS/NTFS
/dev/sdg2       102398310   398267414   147934552+   f  W95 Ext'd (LBA)
/dev/sdg5       102398373   398267414   147934521    7  HPFS/NTFS

Disk /dev/sdh: 164.7 GB, 164696555520 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 20023 cylinders, total 321672960 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0x03750374

   Device Boot      Start         End      Blocks   Id  System
/dev/sdh1   *          63   157806494    78903216    7  HPFS/NTFS
/dev/sdh2       157806495   321669494    81931500    7  HPFS/NTFS

Disk /dev/sdi: 80.0 GB, 80026361856 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 9729 cylinders, total 156301488 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0x219ddc5a

   Device Boot      Start         End      Blocks   Id  System
/dev/sdi1              63   156296384    78148161    c  W95 FAT32 (LBA)

と出ました。

また、SSDは「OCZ Vertex」というものです。

よろしくお願いします。

# うひょほっ　電源大丈夫ですか？

ありがとうございました。
さて、再度LiveCD(Ubuntu インストールCD)で起動させて、「インストールせずにUbuntuを試してみる」で起動させて、Gpartedを起動。
sda1のWindows領域を縮小してみてください。

尚、この時結構な負荷をSSDにかけると思われますので、万が一のためデータのバックアップなどを実施の上で操作されてください。

縮小作業が終了したら、空き領域にパーテーションを、取り敢えず一つで構わないので作成しておいてください。
ファイルシステムは何でも構いません。
次に、デスクトップにインストールアイコンがありますので、アイコンをクリックしてインストールを開始してください。
パーテショニングの画面で、「それぞれ別のものとして・・・」を選択すると、パーテーションを自動的に設定してインストールが開始されます。

Michi-37さん による投稿:

修復をしてみたほうがいいのでしょうか？

しなければいけないでしょうね。
修復法はメーカーから修復ツールが出ていれば、それを使用してください。
そうでない場合は、フリーなツールも出ているようです。
Windowsで行う場合、Windows XP でディスクのエラーをチェックする方法を参考にどうぞ。

いずれにせよ、Windows環境のバックアップは必須ですね。

チェックディスク完了後にGpartedを試用してパーテーションの分割は実行されましたか？
結果は如何でしたか？

これまでUbuntuやLinuxを触ったことがないというなら、まずは別ドライブにインストールして取り敢えず使ってみるというのもありですね。
また、SSDということもあり、既存の環境を大きく変えてしまうと、ちょっと不安もありますし。

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