kaonasiさん
利用されている稼働環境は、Ubuntu8.04LTSですか?
こちらにも明記されていますが、Adobe Airの動作するUbuntuは9.10以降が必要条件です。
http://ja.wikipedia.org/wiki/Adobe_Integrated_Runtime
そのため、支障が出たと推察します。
最新の安定版にアップグレードされればいいかなと思います。
Ubuntu10.04LTSへの移行を勧めます。それからAdobe Airを導入してください。

Adobe Air 1.5系なら ≧Ubuntu 7.10
http://www.adobe.com/support/documentation/jp/air/releasenotes.html

あと、焦ってアップグレードせず、まずはライブCD上で試すのが安全です。

STGSAGWANさんが助言されているように、まずそちらから試行されのがよいと私も思います。
Ubuntu10.04への移行にはそれなりの問題を含みますので。。。

私も保有している６台のマシンの中で、ATI X1650XTの関係から１機種のみUbuntu9.04で止まっていました。
確かに私の場合、この環境でAdobe Airは問題なく稼働していました。どうしても最新版にできなかった推移があります。

やっとUbuntu9.04からUbuntu10.10へ移行しました。
しかしながら起動後に画面関連の操作をしないとまともに動作しないなど、以前不安定です。
アップグレードは、必要悪でそれなりの問題を抱え込みます。

他所のHPからadobe air 1.53を入手することで前記の問題はすべてクリアー出来ました。
プリントマジックも問題無しにインストール出来ましたが、、、、、
肝心の印刷だけは未だに出来ない状態です。

詳しく書きますと、、、、、
印刷ボタンを押すと通常のメッセージが出て、上部パネル右側にプリンターのマークが出ます。
普通ならここでしばらく待つとプリンターが動き出すのですが、、、、全く反応しません。
プリンターのマークは数秒後消えます。
印刷ジョブの管理にて内容を確認していると、最初は印刷内容が出てるのですが数秒後にこれも消えます。
印刷データーがどこか別のところに行っているような感じです。