ATI Fire GL V3100のアナログ出力（D-Sub15Pinコネクタ）に接続されているモニターの表示が正常でないようなので、カードの出力信号が異常かモニターに
異常があるのか切り分けのため、正常に表示されている23インチモニターをアナログ出力（D-Sub15Pinコネクタ）に接続してみてください。

と、言うことは15インチのモニターが不具合か、出力信号が適切でないと思います、1280×1024・1024×768・800×600・640×480のうちどの解像度に設定されていますか。
DVIからアナログへ変換コードあるいは変換プラグをお持ちでしたら、DVIの出力に接続してみれば、モニターの不具合かどうか確認出来ます。

NVIDIA X Server Settingはどのように設定されていますか。

xorg.confが存在しなかったので、リカバリーモードからxorg.conf.newを作成しました。
その内容を提示します。

Section "ServerLayout"
    Identifier     "X.org Configured"
    Screen      0  "Screen0" 0 0
    InputDevice    "Mouse0" "CorePointer"
    InputDevice    "Keyboard0" "CoreKeyboard"
EndSection

Section "Files"
    ModulePath   "/usr/lib/xorg/modules"
    FontPath     "/usr/share/fonts/X11/misc"
    FontPath     "/usr/share/fonts/X11/cyrillic"
    FontPath     "/usr/share/fonts/X11/100dpi/:unscaled"
    FontPath     "/usr/share/fonts/X11/75dpi/:unscaled"
    FontPath     "/usr/share/fonts/X11/Type1"
    FontPath     "/usr/share/fonts/X11/100dpi"
    FontPath     "/usr/share/fonts/X11/75dpi"
    FontPath     "/var/lib/defoma/x-ttcidfont-conf.d/dirs/TrueType"
    FontPath     "built-ins"
EndSection

Section "Module"
    Load  "glx"
    Load  "record"
    Load  "dri2"
    Load  "dri"
    Load  "dbe"
    Load  "extmod"
EndSection

Section "InputDevice"
    Identifier  "Keyboard0"
    Driver      "kbd"
EndSection

Section "InputDevice"
    Identifier  "Mouse0"
    Driver      "mouse"
    Option        "Protocol" "auto"
    Option        "Device" "/dev/input/mice"
    Option        "ZAxisMapping" "4 5 6 7"
EndSection

Section "Monitor"
    #DisplaySize      300   230    # mm
    Identifier   "Monitor0"
    VendorName   "SNY"
    ModelName    "PCVD-15XM2"
    HorizSync    30.0 - 50.0
    VertRefresh  59.0 - 61.0
    Option        "DPMS"
EndSection

Section "Device"
        ### Available Driver options are:-
        ### Values: <i>: integer, <f>: float, <bool>: "True"/"False",
        ### <string>: "String", <freq>: "<f> Hz/kHz/MHz",
        ### <percent>: "<f>%"
        ### [arg]: arg optional
        #Option     "NoAccel"                # [<bool>]
        #Option     "SWcursor"               # [<bool>]
        #Option     "Dac6Bit"                # [<bool>]
        #Option     "Dac8Bit"                # [<bool>]
        #Option     "BusType"                # [<str>]
        #Option     "CPPIOMode"              # [<bool>]
        #Option     "CPusecTimeout"          # <i>
        #Option     "AGPMode"                # <i>
        #Option     "AGPFastWrite"           # [<bool>]
        #Option     "AGPSize"                # <i>
        #Option     "GARTSize"               # <i>
        #Option     "RingSize"               # <i>
        #Option     "BufferSize"             # <i>
        #Option     "EnableDepthMoves"       # [<bool>]
        #Option     "EnablePageFlip"         # [<bool>]
        #Option     "NoBackBuffer"           # [<bool>]
        #Option     "DMAForXv"               # [<bool>]
        #Option     "FBTexPercent"           # <i>
        #Option     "DepthBits"              # <i>
        #Option     "PCIAPERSize"            # <i>
        #Option     "AccelDFS"               # [<bool>]
        #Option     "IgnoreEDID"             # [<bool>]
        #Option     "CustomEDID"             # [<str>]
        #Option     "DisplayPriority"        # [<str>]
        #Option     "PanelSize"              # [<str>]
        #Option     "ForceMinDotClock"       # <freq>
        #Option     "ColorTiling"            # [<bool>]
        #Option     "VideoKey"               # <i>
        #Option     "RageTheatreCrystal"     # <i>
        #Option     "RageTheatreTunerPort"     # <i>
        #Option     "RageTheatreCompositePort"     # <i>
        #Option     "RageTheatreSVideoPort"     # <i>
        #Option     "TunerType"              # <i>
        #Option     "RageTheatreMicrocPath"     # <str>
        #Option     "RageTheatreMicrocType"     # <str>
        #Option     "ScalerWidth"            # <i>
        #Option     "RenderAccel"            # [<bool>]
        #Option     "SubPixelOrder"          # [<str>]
        #Option     "ClockGating"            # [<bool>]
        #Option     "VGAAccess"              # [<bool>]
        #Option     "ReverseDDC"             # [<bool>]
        #Option     "LVDSProbePLL"           # [<bool>]
        #Option     "AccelMethod"            # <str>
        #Option     "DRI"                    # [<bool>]
        #Option     "ConnectorTable"         # <str>
        #Option     "DefaultConnectorTable"     # [<bool>]
        #Option     "DefaultTMDSPLL"         # [<bool>]
        #Option     "TVDACLoadDetect"        # [<bool>]
        #Option     "ForceTVOut"             # [<bool>]
        #Option     "TVStandard"             # <str>
        #Option     "IgnoreLidStatus"        # [<bool>]
        #Option     "DefaultTVDACAdj"        # [<bool>]
        #Option     "Int10"                  # [<bool>]
        #Option     "EXAVSync"               # [<bool>]
        #Option     "ATOMTVOut"              # [<bool>]
        #Option     "R4xxATOM"               # [<bool>]
        #Option     "ForceLowPowerMode"      # [<bool>]
        #Option     "DynamicPM"              # [<bool>]
        #Option     "NewPLL"                 # [<bool>]
        #Option     "ZaphodHeads"            # <str>
    Identifier  "Card0"
    Driver      "radeon"
    BusID       "PCI:1:0:0"
EndSection

Section "Screen"
    Identifier "Screen0"
    Device     "Card0"
    Monitor    "Monitor0"
    SubSection "Display"
        Viewport   0 0
        Depth     1
    EndSubSection
    SubSection "Display"
        Viewport   0 0
        Depth     4
    EndSubSection
    SubSection "Display"
        Viewport   0 0
        Depth     8
    EndSubSection
    SubSection "Display"
        Viewport   0 0
        Depth     15
    EndSubSection
    SubSection "Display"
        Viewport   0 0
        Depth     16
    EndSubSection
    SubSection "Display"
        Viewport   0 0
        Depth     24
    EndSubSection
EndSection

ATI Fire GL V3100に対するドライバーをインストール必要があると思います。Ubutu10.10の場合「システム」→「システム管理」→「追加のドライバー」から
インストール出来れば簡単ですが、ATI Fire GL V3100には対応してないようなので、別途手動インストールになるようです。
ドライバーは下記に存在しますが、はたしてUbuntuに適応しているかどうかは不明ですが、ダウンロードしインストールしてみる価値はあると思います。

http://support.amd.com/us/gpudownload/Pages/index.aspx

AMD Catalyst Display Driver
Step1 でWorkstation Graphicsを選択
Step2 でFireGL Seriesを選択
Step3 でFireGL V3100を選択
Step4 でLinux x86 or Linux x86_64を選択

当方にもATI Fire GL V3100が在りましてLinux-ubuntu9さんと同じ状況になり深く追求するのを止めまして「HD4670」に直ぐ取り替えました。

Linux-ubuntu9 による投稿:

あと何故かubuntuを起動する度に、視覚効果が効果なしになってしまいます。
効果なしだと、サブディスプレイもしっかりできているんですが
追加効果に設定し直すと#1の写真のようにサブモニターの表示がおかしくなります。

詳細なデータを掲示すると明確な回答が得られるかも知れません。
＊グラフィックボードのメモリー搭載量
＊メイン、サブモニターの解像度と色数
＊ATIの対応ドライバをインストールした時の状況

Linux-ubuntu9様

ハードのスペックから推察できることを書かせていただきます。

まずは、グラフィックメモリが少なすぎると思います。フルＨＤ＋SVGAでハイカラー以上の表示となると最低でも512MBは必要かと思います。
Ubuntuは特殊効果が選択可能な状態ではないと判断した場合、自動的に通常効果になるようですので、そのせいで効果なしのチェックに戻っているのだと思います。
色数については、多分WindowsXpのデュアルディスプレイ環境では、色数が制限されていると思いますが、確認してみてはいかがでしょうか。

そして、このスペックのグラフィックカードでのConpizの動作は難しいと思います。
理由は、上記と同じ理由です。チップの処理能力的にはnavidia7600シリーズ位の処理能力はあるのですが、如何せんメモリが少ないです。
やはり、最低でも512MB以上はほしいです。

以上の推察理由から、conpiz利用でのデュアルディスプレイ環境はは厳しいのではないかと思います。

Linux-ubuntu9様

消費電力が気になると言うことですが、ローエンドグラフィックボードで、Ubuntuが対応しているものなら動作可能だと思います。
Radeonなら４０００シリーズのローエンド４３５０などは公称20Wと消費電力も少なく追加の電源コネクターもないのでおすすめです。
Ubuntu10.10でRadeon４０００シリーズまでなら標準のドライバーで動くようになったそうです。（Linux100%誌の情報より）
それ以外ですと、プロプライエタリなドライバーを導入する事になりますが、新しい目のグラフィックボードなどは対応していないことが多いので気をつけてください。

Linux-ubuntu9さん、当方のサブマシンがPrecision380ですが、ATIのRadeon HD4670(ファンレス)に取替えていますが、当時電源容量等考慮もせず交換したのですが、なんら問題無く使用出来ています。
Ubuntu10.10（Amd64）では、ドライバーのインストールも「システム」→「システム管理」→「追加のドライバー」から容易に出来ます。