shirox による投稿:

デスクトップのパネルのデザインを
好みにかえることはできないんでしょうか？

パネル上で、マウスの右ボタンで、プロパティを選んで、「背景」タブから変更できます。
単色はグラディーションもできますし、特殊なパターンの背景画像はｊpegファイルで作ってください。
上下別々の色で表示できます。

パネルのデザインって只の棒状だから色関係以外に何処を変更されたいのでしょうか。
その棒状のものにblender等の3Dグラフィックで作成した物を画像に変換して使用すれば何でも有りの様な気もするけど、そういうのとは違うのかな？

どういうカスタマイズを希望されているのか明確にしていただくのがよさそう、というのに賛成です。
変更可能なことのほとんどは以下を見ることで確認できるかと思います。
http://gnome-look.org/

上記サイトで公開されているものを見て、気に入ったものがあればそれをもらってきて使うというのもよいでしょう。
ちょっとハードルが高いですがもらってきたものの内容を勉強、理解し、それらをベースに好きなように変更して使うのもよいでしょう。

shirox による投稿:

もう少し補足をさせていただきます
パネルをブラッディマンディのfalcon os
のようにしたいのですが…

falcon osなるものを見たことがない私にはどういうものかイメージできませんし、
某テレビ局で放映されたドラマに登場したものであれば著作権の問題がありスクリーンショットなどを投稿していただくわけにもいかないため、
ちょっと議論しにくいのですが、今朝方ご紹介した、
http://gnome-look.org/
には適当なものはなかったでしょうか。
shiroxさんのイメージに近いものがあれば、それをベースに改造することになりますが、これにはgnomeテーマに関する知識が必要となりちょっと手間かと思いますので、現実的な範囲としてはイメージに近いものをgnome-lookなどで探して使っていただくのがよいかと思います。