PC起動
↓
MBR(日本語)が表示され
Windows 7
Ubuntu
二番目のUbuntu選択
↓
grubが起動し、Linuxのカーネルを選択

といったようにさせたいです。

MBRのプログラムにはOSを選択する画面を表示する機能はありません。
MBRはアクティブな領域のブートセクタの位置をBIOSに示すだけです。

デュアルブートの為にはwindwosブートマネージャかgrubのような
選択機能があるブートマネージャかブートローダを経由しなければなりません。

したがってMBRをオリジナルのままデュアルブートするにには
１．MBR→windowブートマネージャ→winload.exe→windows
　　　　　　　　　　　　　　　　　　→grub→ubuntu

２．MBR→grub→windwosブートマネージャ→winload.exe→windows
　　　　　　　　→ubuntu
のいずれかを選択しなければなりません。

いずれにしてもgrubはubutnuをインストールする領域のブートセクタにインストールします。
１．はBCDという設定書類を編集して手動でgrubへのエントリーを追加する必要があります。
　　easybcdを使うと楽でしょう。

２．はubuntuをインストールした領域をアクティブにします。
　　grubにwindowsの領域のブートセクタへのエントリーが自動的に追加されますので
　　オートマティックでデュアルブートになります。
　　（もちろんubuntuの領域が基本領域である必要があります。）

その際、ブートローダのインストールデバイスをHDDの２番目のパーティションに選択すれば可能でしょうか?
（また、可能でしたら以降のgrubアップデート時の注意点等があれば教えていただきたいです。

はい、２番目のっていうか、ubuntuをインストールした領域を選択します。
grubのアップデートは特に注意は必要ないと思います。

すみません

さっそく問題が発生しました。
grubのインストール先が
HDD(/dev/sda)とwindows(/dev/sda1)の二つしかありませんでした。
現在はしょうがなく、/dev/sdaにインストールさせましたが
やはりgrub->windowsMBR->windows起動
という仕様になってしまいました。

grubのインストール先はどうすればいいでしょうか?
もう一つパーティションを切った方がいいでしょうか?
1.Windows
2.grub用(未フォーマット)
3.Ubuntu

やはりgrub->windowsMBR->windows起動
という仕様になってしまいました。
grubのインストール先はどうすればいいでしょうか?

MBRをWindowsのものに書き戻して再チャレンジということでしょうか？
それでしたら
$ sudo grub-install -f /dev/sda2
$ sudo update-grub

パーティションエディタを起動して/dev/sda2 にbootフラグを立てる。で解決しないでしょうか。

ubuntuが基本領域（通常は/dev/sda1～/dev/sda3 拡張領域を作成していない場合は/dev/sda4 も含みます）にインストールされている事が前提です。

/dev/sda2 のUbuntuを起動して/dev/sda2にGRUB2をインストールしgrub.cfgを更新させて起きます。
$ sudo grub-install -f /dev/sda2
$ sudo update-grub

GPartedを起動して/dev/sda2を右クリック。
「フラグ」を選択して[boot]にチェックを入れて閉じる。

HDDのMBRをWindowsのものに書き戻す。
再起動。

grubのインストール先を変更
$ sudo grub-install -f /dev/sda2
$ sudo update-grub
その後、MBRに上書きしてしまったgrubを削除してMBRを修復

ここまでは間違いありません。

windowsからツール等を使用してMBRの表示の方に/dev/sda2のエントリーを追加
といった手順でよろしいのでしょうか?

重ねて申し上げますが、MBRにはOSの選択やそれを表示する機能はありません。
MBRにエントリーを追加することは不可能です。
/dev/sda1がアクティブなら/dev/sda1のブートセクタに処理が渡りますし、
/dev/sda2がアクティブなら/dev/sda2のそれに処理が渡ります。
これは選択の余地がありません。

OSの選択の機能があるのはウィンドウズブートマネージャかgrubです。
いずれかを使ってOSを選択することになります。

ウィンドウズブートマネージャを使う場合は/dev/sda1をアクティブにして
easybcdなどでbcdにgrubへのエントリーを追加します。
（ウィンドウズブートマネージャは直接linuxを起動できませんので必ずgrub経由です。）

grubを使う場合は/dev/sda2をアクティブにすれば自動的にデュアルブートができます。

sempookさん
すみません、癖でMBRと書いてしまいました。

現在、MBRを修復しました。
hir0さんが書かれた

GPartedでbootフラグを/dev/sda2 に付ける。

というのはUSBもしくはインストールディスクからUbuntuを起動させ、HDDの/dev/sda2にbootフラグをつければよいのでしょうか?

/dev/sda1のbootフラグを外して/dev/sda2に付けます。

ごめんなさい。
私が書いているのはMBRを含め、Windowsに変更を加えずにデュアルブートを行う方法です。
方法としては＃８と＃９を読んでください。
＃１０に説明が書かれているので読んでください。

>/dev/sda2にbootフラグを付けてしまったら
>ウィンドウズブートマネージャが起動しないのではないのでしょうか?
この質問の答えは#2を読んでください。

質問の内容が#1に書いてあるように「Windowsのブートローダーから起動したい」、つまりWindowsのメニュー選択画面からUbuntuを起動したいのでしたら#2にあるようにWin7のメニューにエントリーを追加して抜き取ったPBRかgrub4dosのgrldrを使用するとお望みの状態になるかと思います。

エラーコードです。

$ sudo grub-install -f /dev/sda2
/usr/sbin/grub-probe: error: cannot find a device for /boot/grub (is /dev mounted?).
No path or device is specified.
Try '/usr/sbin/grub-probe --help' for more information.
Auto-detection of a filesystem module failed.
Please specify the mount with the option '---modules' explicitly

ここで２つ質問したいことがあります。
いままでの上記の質問も踏まえて
1.grub2はどこへどのようにしてインストールするか(MBRに上書きさせない)
2.ウィンドウズブートマネージャに追加するエントリーの情報はどこから読み取るのか
この２つをお聞きしたいです。

grub4dosを使用して起動することができました。
ありがとうございます。

たぶんこれが最後の質問になると思うのですが
MBR->ウィンドウズブートマネージャ->grub4dos->grub2->Ubuntuという起動になりますよね?
grub4dosはCドライブ直下のmenu.lstを読み込んで旧grubのように選択して起動できるようになっていますがそれを自動選択することは出来るでしょうか?

menu.lstの中には

title    Linux Ubuntu
root (hd0,3)
kernel /boot/grub/core.img

と書いてあるだけです。
これ一つしかないのですがこれを自動選択することができれば
MBR->ウィンドウズブートマネージャ->Ubuntuを選択
(grub4dosが起動しLinux Ubuntuと表示されるのでEnter)←ここを省略し自動化
grub2起動->Ubuntu
という感じになりますよね?
これは可能でしょうか?

できればUbuntuを起動させる前にgrub2を通したいです。
何かあった際、リカバリーモードから起動できるようにもしたいですし。。。

menu.lstを再度編集したのですが今度は適応されなくなりました。
defultやrebootを追加してみたのですが表示は変わらず

誤解を招くような書き方をしてすみません。

menu.lst内のroot (hd0,3)
の数値を何度か変えてどの数値で起動できるか試していたのですが
その際、コード全体では

title    Linux Ubuntu
root (hd0,?)
kernel /boot/grub/core.img

というコードにして保存し、実行していました。
数値が0,3で起動できることが確認できたので今度はこのコードに
メニューを非表示にさせるコードや新しくエントリーを追加してみようと思ったのですが上書き保存し、再起動しても反映されませんでした。

起動はするのですがその後に追加したコードすべてが反映してくれないという状況です。