まずは、Ubuntuのバージョンを投稿下さい。

matsu-in による投稿:

HDDは1つでもともとwindows vistaがインストールしてありました。
windows上でEASEUS Partition Managerを使用しパーティションを分割して
分割した片方にubuntuをインストールし使用してました。起動した時にwindowsかubuntuか選べるようになってました。

以前、Ubuntuをインストールした際に、ブートローダ(grub2)をどこにインストールしたかわかりますでしょうか。
もし、grub2をMBRにインストールしていれば、grub2の画面でWindowsを起動するかUbuntuを起動するか選択するようになっていたはずです。
あるいは、grub2をPBRにインストールしてEasyBCDなどでWindowsのブートローダを設定していたりしますでしょうか。

matsu-in による投稿:

問題が起きたのは、windowsの調子が悪くなったのでwindows領域をフォーマットしてwindows7をインストールしたら起動したときにwindowsかubuntuか選べることが出来ずwindows7が起動してしまいます。

恐らくWindows7をインストールしたときにMBRにWindows7のブートローダを呼び出すコードが書込まれたものと思われます。
grub2がMBRにインストールされていた場合、上書きされてしまっています。
もし、grub2をPBRにインストールしていたのであれば、前回したはずの手順にそって、Windowsのブートローダを設定すればPBRにあるgrub2を呼び出す設定ができるかと思います。

grub2がMBRにインストールされていた場合は、再度、grub2をインストールしなおす必要があります。Windows7側でCD-Rを焼くことができれば、
http://www.supergrubdisk.org/category/download/supergrub2diskdownload/
からSuperGrub2Diskのイメージをダウンロードし、CD-Rに焼いて、PCをSuperGrub2DiskのCD-Rから起動してみて下さい。
SuperGrub2DiskからUbuntuを検出、起動できれば、Ubuntuを起動してgrub2をインストールし直せばよいかと思います。

hmatsue様

SuperGrub2Diskというものを落として起動してみるとubuntuを選んで起動することが出来ました。

その後、色々調べてこのページ（ttp://liberos.info/?p=3410）のGRUB2の修復作業を実行してみると無事治りました。

本当に助かりました（実はwindowsを再インストールする際の作業データバックアップをubuntu領域に移しておりました）ありがとうございました。

hmatsue による投稿:

このKernel Loaderが最初MBRにインストールしてあって、Windowsの再インストールにより上書きされてしまったという現象であったようです。

細かいですが一点修正。
特別Windowsのブートマネージャからgrubを呼び出す設定をされたわけでは無いようなので、上記と推測します、です。

Windows側は全く知らないのですが、
http://en.wikipedia.org/wiki/Windows_Vista_startup_process
を見ると、Windowsのブートマネージャから最終的にはwinload.exeというWindowsのKernel　Loader(という表現が適切か微妙かも知れませんが)が起動されるようです。

grub2でWindowsを選択した場合、Windowsのブートマネージャがチェーンロードされ、そこからwinload.exeが呼び出されているはずだと思います。

Windowsのブートマネージャ経由でUbuntuを起動する場合、WindowsのBCDを編集して、PBRにインストールしたgrub2にチェーンロードするよう設定することになるかと思います。この場合は、MBRはWindowsがインストールするWindowsのブートマネージャを呼び出すコードのまま残すことになります。なお、前回少し触れたEasyBCDはBCD編集補助のツールの名前です。