hir0さん、コメントありがとうございました。アドバイスの内容を試してみましたが、残念ながら結果は同じでした。

Ubuntuの方は起動するのですよね？
GRUB２の設定はシステムが自動で行います。
ユーザーカスタマイズのメニューを登録する方法も用意されていますが、今回は根本的な原因を改善しないといけない様です。
次のコマンドの結果をください。

$ sudo fdisk -l
$ sudo os-prober
$ gedit /boot/grub/grub.cfg
$ sudo blkid

一つ確認です。
GRUBがインストールされているHDDにWindowsをインストールされたのですよね。
そうすると起動時にはGRUBではなくWindowsのブートローダが起動するはずですが、GRUBが起動してしまうということはWindowsのブートローダがインストールに失敗開いた可能性も有ります。
幾つかの事例と対策は出ていますが、取り敢えずは状況の確認の為に上記のコマンドの出力結果をお願いします。

GPTは次世代？新方式のパーティションテーブルなので気にしなくても大丈夫です。
使用した「fdisk」と言うコマンドが新しいタイプを分析して表示する機能が無いだけです。

WindowsのHDD＝/dev/sda
UbuntuのHDD  ＝/dev/sdb

ですね。
もう一度確認しますが、Ubuntuは起動するのですよね。そして　「$ sudo update-grub」 の実行後も変化無しで良いでしょうか。

明日は遅くなりそうなので、他のメンバから書き込みが有りましたら続けてください。

hir0さん、

「$ gedit /boot/grub/grub.cfg」の結果は以下のとおりです。

＜ここから＞
#
# DO NOT EDIT THIS FILE
#
# It is automatically generated by /usr/sbin/grub-mkconfig using templates
# from /etc/grub.d and settings from /etc/default/grub
#

### BEGIN /etc/grub.d/00_header ###
if [ -s $prefix/grubenv ]; then
  load_env
fi
set default="0"
if [ ${prev_saved_entry} ]; then
  set saved_entry=${prev_saved_entry}
  save_env saved_entry
  set prev_saved_entry=
  save_env prev_saved_entry
  set boot_once=true
fi

function savedefault {
  if [ -z ${boot_once} ]; then
    saved_entry=${chosen}
    save_env saved_entry
  fi
}

function recordfail {
  set recordfail=1
  if [ -n ${have_grubenv} ]; then if [ -z ${boot_once} ]; then save_env recordfail; fi; fi
}
insmod ext2
set root='(hd1,2)'
search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
if loadfont /usr/share/grub/unicode.pf2 ; then
  set gfxmode=640x480
  insmod gfxterm
  insmod vbe
  if terminal_output gfxterm ; then true ; else
    # For backward compatibility with versions of terminal.mod that don't
    # understand terminal_output
    terminal gfxterm
  fi
fi
insmod ext2
set root='(hd1,2)'
search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
set locale_dir=($root)/boot/grub/locale
set lang=ja
insmod gettext
if [ ${recordfail} = 1 ]; then
  set timeout=-1
else
  set timeout=10
fi
### END /etc/grub.d/00_header ###

### BEGIN /etc/grub.d/05_debian_theme ###
set menu_color_normal=white/black
set menu_color_highlight=black/light-gray
### END /etc/grub.d/05_debian_theme ###

### BEGIN /etc/grub.d/10_linux ###
menuentry 'Ubuntu, with Linux 2.6.32-28-generic' --class ubuntu --class gnu-linux --class gnu --class os {
    recordfail
    insmod ext2
    set root='(hd1,2)'
    search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
    linux    /boot/vmlinuz-2.6.32-28-generic root=UUID=fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2 ro   quiet splash
    initrd    /boot/initrd.img-2.6.32-28-generic
}
menuentry 'Ubuntu, with Linux 2.6.32-28-generic (recovery mode)' --class ubuntu --class gnu-linux --class gnu --class os {
    recordfail
    insmod ext2
    set root='(hd1,2)'
    search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
    echo    'Loading Linux 2.6.32-28-generic ...'
    linux    /boot/vmlinuz-2.6.32-28-generic root=UUID=fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2 ro single
    echo    'Loading initial ramdisk ...'
    initrd    /boot/initrd.img-2.6.32-28-generic
}
menuentry 'Ubuntu, with Linux 2.6.32-27-generic' --class ubuntu --class gnu-linux --class gnu --class os {
    recordfail
    insmod ext2
    set root='(hd1,2)'
    search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
    linux    /boot/vmlinuz-2.6.32-27-generic root=UUID=fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2 ro   quiet splash
    initrd    /boot/initrd.img-2.6.32-27-generic
}
menuentry 'Ubuntu, with Linux 2.6.32-27-generic (recovery mode)' --class ubuntu --class gnu-linux --class gnu --class os {
    recordfail
    insmod ext2
    set root='(hd1,2)'
    search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
    echo    'Loading Linux 2.6.32-27-generic ...'
    linux    /boot/vmlinuz-2.6.32-27-generic root=UUID=fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2 ro single
    echo    'Loading initial ramdisk ...'
    initrd    /boot/initrd.img-2.6.32-27-generic
}
menuentry 'Ubuntu, with Linux 2.6.31-22-generic' --class ubuntu --class gnu-linux --class gnu --class os {
    recordfail
    insmod ext2
    set root='(hd1,2)'
    search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
    linux    /boot/vmlinuz-2.6.31-22-generic root=UUID=fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2 ro   quiet splash
    initrd    /boot/initrd.img-2.6.31-22-generic
}
menuentry 'Ubuntu, with Linux 2.6.31-22-generic (recovery mode)' --class ubuntu --class gnu-linux --class gnu --class os {
    recordfail
    insmod ext2
    set root='(hd1,2)'
    search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
    echo    'Loading Linux 2.6.31-22-generic ...'
    linux    /boot/vmlinuz-2.6.31-22-generic root=UUID=fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2 ro single
    echo    'Loading initial ramdisk ...'
    initrd    /boot/initrd.img-2.6.31-22-generic
}
### END /etc/grub.d/10_linux ###

### BEGIN /etc/grub.d/20_memtest86+ ###
menuentry "Memory test (memtest86+)" {
    insmod ext2
    set root='(hd1,2)'
    search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
    linux16    /boot/memtest86+.bin
}
menuentry "Memory test (memtest86+, serial console 115200)" {
    insmod ext2
    set root='(hd1,2)'
    search --no-floppy --fs-uuid --set fbfea167-5351-4f37-92db-1c0806c167e2
    linux16    /boot/memtest86+.bin console=ttyS0,115200n8
}
### END /etc/grub.d/20_memtest86+ ###

### BEGIN /etc/grub.d/30_os-prober ###
menuentry "Windows NT/2000/XP (loader) (on /dev/sda1)" {
    insmod ntfs
    set root='(hd0,1)'
    search --no-floppy --fs-uuid --set 1AC4A9A6C4A9851B
    drivemap -s (hd0) ${root}
    chainloader +1
}
### END /etc/grub.d/30_os-prober ###

### BEGIN /etc/grub.d/40_custom ###
# This file provides an easy way to add custom menu entries.  Simply type the
# menu entries you want to add after this comment.  Be careful not to change
# the 'exec tail' line above.
### END /etc/grub.d/40_custom ###

＜ここまで＞

先週末、「とにかくGrubの設定ファイルと思しきものの中の Windowsをインストールした HDDの旧UUIDを新しいUUIDに書き換えればうまくいくはず。」と考え、関連しそうなgrub.cfgの内容を書き換えました。ところがうまくいかないのでさらに調べてみると、grub.cfgは出力結果なので編集すべきでない、というような記述を読みました。このファイルの先頭にも編集しないよう注意書きがあることに今気づき、愕然としています。grub.cfgの内容は敢えて元には戻していません。
grub.cfgを書き換えた後は、GrubメニューでWindowsを選択しようとした際に表示されるエラーメッセージには新しい UUID が表示されます。しかしWindowsは依然として起動しないままです。長くなりましたので、次のコマンドの実施結果は後ほどご連絡します。

う～ん、全て正常に見えます。

システムも全て/dev/sda,/dev/sda1を認識してNTFSでありWindowsであると認識しています。
もちろん、その認識はGRUB2の設定に反映されています。

何か特殊な状態に陥ってしまったか、単純な落とし穴にハマってしまっているのか。。。
何かアドバイスが出なければ、最初からGRUB２を入れ直してみましょう。

次のコマンドを一行ずつ実行してみてください。

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get --reinstall install grub2
$ sudo grub-install /dev/sda
$ sudo update-grub

再起動です。


起動しない場合は、GRUB２のOS選択画面で[C]キーを押してください。
プロンプトが　
grub>

と表示されていると思いますので
grub> ls

と入力すると認識しているデバイスが表示されます。
WindowsのHDDは(hd0)、Windowsのパーティションは(hd0,1)もしくは(hd0,msdos1)と表示されるはずです。

表示されればGRUB2はHDDと、そのパーティションを認識しています。
(便宜上(hd0,msdos1)は(hd0,1)と書きます、環境に合わせて読み替えてください）


grub> ls (hd0,1)/

Cドライブの中が表示されれば（windowsフォルダ等）NTFSファイルシステムも理解できています。
Windowsに制御を渡してみます。

grub> set root=(hd0,1)
grub> chainloader +1

[ctrl] + [X] キー

自己レスです。

あまりhir0さんばかりに頼っているのも情けない気がして調べたところ、以下のサイトに説明がありました。
https://help.ubuntu.com/community/Grub2
Tab を使って<OK>を選択後、Enter キーを押せば良いことが分かりました。
まだ完了していませんが、少しあがいてみます。

#11の操作を正常終了しました。
実は昨日色つきの画面を強制終了した後何らかの操作をしていたら、プロセスが完了していないので、あるコマンドを実行するようメッセージが表示されたので、そのとおりに実行したら、色つきの画面が立ち上がり、その後を継続することができました。期待しつつ再起動しましたが、結果はうまくいきませんでした。エラーメッセージは以下のとおりでした。
　error: no such device: <UUID>.
　error: no such partition.　　←この行が追加されたようです。
　続けるには何かキーを押してください…

本日#11の操作を再実行し、正常終了しました。しかし、再起動後の結果は上記と同じでした。

>何か特殊な状態に陥ってしまったか、単純な落とし穴にハマってしまっているのか。。。
後者ではないかといろいろ考えをめぐらし、「（CDやFDDを優先させる必要があったので）BIOSのBOOT設定を何度もいじった際、HDDの指定を誤ったかも？」と思い、確認してみましたが、WindowsのHDDを指定しており問題ありませんでした。（というか、UbuntuのHDDを指定することはできないようでした。）

いずれにせよ、Windowsが起動しない問題は未だに解決せず、ますます難しい局面に陥っているようです。
hir0さんがこれまでくださったアドバイス以外に、現状を打開するような策はないものでしょうか？

>GRUBから離れてみませんか？
文面からははっきりしませんがgrubのコマンドモードを試していないようなので、grubでもう少しあがいたら新しい発見があるかもしれない。

hir0さん、

どうも文脈を取り違えていたようです。
#6における「grub> ls (hd0,1)/」以降の一連のコマンドは、再起動しない場合に実行すべきものと思い込んでいました。「grub>」なるプロンプトはどのようにして表示させるのでしょうか？

昨夜は寝ぼけていました。参照すべきは#6ではなく、#11でした。

#11で、再起動の話の後で「起動しない場合は、…」と続いていましたので、てっきり「再起動しようとしても起動しない場合は…」の意味と誤解して、その後は読み飛ばしていました。失礼致しました。
jackalopeさん、つっこみありがとうございました。おかげで誤解に気づくことができました。

さて、grub のプロンプトに続いてコマンドを実行した結果は以下のとおりです。

（ここから）
grub> ls
(hd0) (hd1) (hd1,3) (hd1,2) (hd1,1) (fd0)

grub>
no such device　　←きちんとメモを取らなかったので多少違っているかもしれません。
（ここまで）

Windows のパーティションを認識していませんね…。

次の一手をご教示願います。

なお、Windowsをインストールした後は、#8の３．に記載しましたように、Grubを再インストールしましたので、Ubuntuは起動します。

grub> ls
(hd0) (hd1) (hd1,3) (hd1,2) (hd1,1) (fd0)

UbuntuのHDDは認識してパーティションが３つ切られていると認識しています。

WindowsのHDDは認識しているが、パーティションを認識していません。

起動したUbuntuのシステム上からは全て問題なく認識をしています。う～ん、どういうことでしょうか？（って質問なんですよね）

$ sudo apt-get install grub
$ sudo grub-install /dev/sda
$ sudo update-grub

#11 と似ていますが一行目がgrub2 → grub に変更です。
この三行を実行してみてください。9.04（だったかな）以前のブートローダがインストールされます。
システムは正常にHDDを認識しているので現在MBRに有るGRUBのバージョンを変えて見ることで（バージョンと言うよりはシステム的に別物）問題を切り分ける糸口が見つかるかもしれません。

ダメな場合は#16 の　$ sudo lilo -M /dev/sda mbr　を試してみてください。
これは、ほぼ通常の動作でWindowsのブートローダを呼び起こします。

もしこれでもダメな場合はMBRのGRUBを削除してからWindowsを再インストールしてみませんか。
過去にMBRにGRUBが残っていることでWindowsの再インストールが失敗する事例が２～３上がっています。
まずは一つずつ確認後に報告を頂ければと思います。

ところで、#16において、「grldr」はＣドライブのどこに置けば良いのでしょうか？また、「Cドライブは上部パネルの「場所」から開けます。」とありますが、これはUbuntuの操作説明ですよね？今Ubuntuは起動しないのですが？？？

こちらがお願いしたことが上手く通じなかった様ですね。
もちろん文章の構成に難が有るのでしょうが、、、

実行して頂いた　lilo -M はWindowsが起動するよう二とお願いしたコマンドなのでWindowsが起動することは期待していた事です。

それによってシステムから正常に認識されているWindowsがGRUBからは認識されない原因の切り分けになるかと思いました。
結果は「Windowsが起動した」で良いのですよね（Windowsのシステム、もちろんパーティションやファイルシステムに異常は無いと私は判断します）
いよいよ持って、GRUB２のみが違う挙動をしている可能性が色濃くなってきますね。


質問の回答に付いてはWindowsの起動法を確保したら、そのままUbuntuの起動法も確保してから再起動です。
説明不足のようでした。

#16 hir0 による投稿:

再起動後にWindowsが起動しますが少し待ってください。
これはbootフラグの有るパーティションをアクティブにするものです。bootフラグは#6のfdisk -l の内容で言うと「ブート」欄に表示されている「＊」マークがそうです。
Windows のパーティションに付いていますね。
HDDが二つ有るのでUbuntuにも付いているかもしれません、2つ有ると混乱して思わぬエラーを招くかも知れないので「システム」→「システム管理」→「GParted」を起動してください。
「GPartedが「無い場合」
ライブCDでは標準付属ですがインストール後のシステムでは入っていないのでインストールします。
$ sudo apt-get install gparted

GParted を起動したら上段右端の「/dev/sda」と表示されている部分の▼マークをクリックして/dev/sdb（UbuntuのHDD）を選択してください。
Ubuntuのパーティションの「フラグ」欄に「boot」と表示されていたら外します。
表示されている欄をシングルクリックで選択して、右クリックでウィンドウを開きます。
「フラグを編集」を選択して「boot」に付いているチェックを外します。

最終的にWindowsのパーティションのみにbootフラグが付いている状態にします。
これでWindowsは起動するので、次にUbuntuの起動方法の確保です。
　　　　　　　　　～～中略～～
Ｃドライブに「menu.lst」の名前で保存してください。
c:\grldr="Ubuntu"
次にCドライブに有る「boot.ini」ファイルを開きます。
最後に一行追加して保存します。

再起動です。

> 「grldr」はＣドライブのどこに置けば良いのでしょうか？
こちらの質問は何と説明したら良いのでしょうか。
Windows上で（マイコンピュータだったかな？）Cドライブを開いてそこにコピペしてください。
boot.iniと同じ階層です。

#16の再起動の後に書き込んでいますが、Windows上で作成したmenu.lstだと文字コードによる問題が起きるかも知れません。（取越し苦労かな）
その場合はライブCDを活用するか可能であればノートパッド等で保存する際の文字コードをUTF-8に指定してみてください。