ご返信、ありがとうございます。
一点、教えてください。
mozc-property とは何でしょうか？

設定ツールだとすれば、どうやって起動するのか、あるいは設定ファイルなのか、ご教示頂ければ幸いです。

makopi さん。
ご教示、ありがとうございます。

設定ツールは、コマンドラインから呼ぶことができました。
が、どうも、この設定項目では私が困っている問題は解決しないようです。
少しわかりにくいかもしれませんが、私が一番困っている（要するに、このままでは使い物にならない）現象は次のようなことです。
例えば「間違えた」と変換させようとしたとします。

  最初の入力文字列： まちがえち
  修正文字列： まちがえ（「ち」を削除する）
  再入力文字列： まちがえた（末尾の「た」を入力しようとすると…）
  表示文字列： まちがえまちがえち（最初の誤った入力文字列が出現してしまう）

おわかりでしょうか？
一体なぜ、このような現象が発生するのか、よくわかりません。
予測変換のような機能が悪さしているのではないかと思っているのですが、不明です。

環境は次の通りです。

   Ubuntu 10.10
   Emacs 23.1
   mozc-utils-gui 0.12.410.102-2
   mozc-server 0.12.410.102-2
   ibus-mozc 0.12.410.102-2
   ibus.el 0.2.1

現時点では、ほぼ標準的な環境だと思っていますが、これで正常に日本語入力できている方はいらっしゃいますでしょうか？

funatogawa さん。

指摘されて気がついたのですが、どうも、未確定文字のバッファがおかしなことになっているようですね。
問題の現象を、もっと詳細に記述すると次のようになります。

  最初の入力文字列： まちがえち（まだ変換しない）
  修正文字列： まちがえ（「ち」を削除する）
               文字「ち」を削除した時点で、未確定変換状態にあることを示す（？）下線が消失する
  再入力文字列： まちがえた（末尾の「た」を入力しようとすると…）
  表示文字列： まちがえまちがえち（最初の誤った入力文字列が出現してしまう）
               しかも、出現した文字列「まちがえち」には未確定状態を示す下線がある

そして、上記の操作を何度か繰り返していると、「最初の誤った入力文字列が出現してしまう」という現象は消失し、通常の文字入力ができるようになります。
ちなみに、.emacs の設定は以下のみです。

    (require 'ibus)
    (add-hook 'after-init-hook 'ibus-mode-on)
    (ibus-define-common-key ?\C-\s nil)
    (ibus-define-common-key ?\C-/ nil)
    (setq ibus-cursor-color '("limegreen" "red" "blue"))
    (global-set-key "\C-\\" 'ibus-toggle)

X 絡みの環境の問題なのかもしれませんが、何かアドバイスを頂ければ。

なるほど。
やってみましょう。
結果は、また別途、ご報告します。