nattyならば、電源マークをクリックするとシステム管理というコントロールパネルが開きます。
その中に、「メインメニュー」がありますので開いてみてください。チェックが付いているのが表示されるアイコンです。
チェックが付いているのに表示されなかったり、そもそも、メインメニューにないものは、アイコンがないか、インストールされたときに読み込まれなかったものですが、そのへんまでくると分かりません。

　以下が参考になると思います。

　http://askubuntu.com/questions/13758/how-can-i-edit-create-new-launcher-items-in-unity-by-hand