基本的には、
1. 接続する
2. ext4, ext3などでフォーマットする
3. /etc/fstabにmountポイントなどの情報を追加する(設定する)
という流れになります。

ハードウェアについては、ごく稀に上手く動かない組み合わせ(相性)などもあるようなので、
http://www23.atwiki.jp/dragonkiller/pages/122.html#id_4f3e27b9
など、ウェブの情報を事前に調べて、問題が報告されていないものを選ぶと、少しはリスクが減るかと思います。