お名前.comを利用したことはありませんが、多分Ubuntuフォーラムの領域を超えた問題だと思われます。

clueless による投稿:

お名前.comのカスタマーサポートに何回も電話をしたのですが、
標準OSを使っていないので何もできないという返答です。

http://www.onamae-server.com/vps/ には「お好みに合わせて選択できるOS」とあり、Ubuntuも載っているのですが、ここで選択したものではないのでしょうか。
いずれにしても、サーバーに接続できないのであれば、フォーラムに尋ねるよりもお名前.comのサポートと交渉を続けて...の方が期待はあるかと思います。

スミマセン、状況の把握がうまくできないもので、、、

サーバー側に問題が発生しているのでしょうか、それとも、自宅パソコン側に問題が発生しているのでしょうか。
自宅パソコンに問題があるならフォーラムで解決できると思いますが、サーバー側に問題があって接続できないとするとフォーラムでは解決できないと思われます。

(ネットワーク関係はあまり得意ではないので、どなたかフォローお願いします。)

通常、VPS の OS を他に変更する場合、サーバの状態はすべて初期化されてしまうと思うのですが、お名前の VPS は違うのでしょうか？
私は、DTI の VPS を使用していますが、他の OS に変更する場合、ディスクはまっ更になって OS が再インストールされ、IP アドレスも変わってしまったりしますが…。

OS を変更すると言う極めて重大な操作をする前に、なぜバックアップを先に取らなかったのかがとても大きな謎ですが、やってしまったものは仕方が無いですね…。

>標準OSからUbuntuに変えたところ、その翌日にお名前の方でサーバーメインテナンスが
>あり、ショップのフロントもバックエンドもまったくたちあがらなくなりました。
とのことですが、
CentOS から Ubuntu に変更した時点では、サイトにアクセス出来たと言うことですか？
だとすると、VPS サーバ自体が謎な仕様の気が…。

バックアップが標準の機能と言うことになっていますが、それは同じ OS で使い続けている場合ではないのでしょうか？

>お名前のコントロールページに
>バックアップリストがあり
>各項目にクリックしてマークするのですが
>バックアップもできません。
と言うのは、
OS を変更したにも関わらず、それ以前にアップロードしてあったファイルがリストアップされると言うことですか？
それは単なる残骸のような気がするのですが、もし、お名前の VPS が特別な仕様になっていて、OS を変更してもデータは残っているナイスな奴ならば、Terminal から SSH 接続してサルベージ出来るかも。
あー、でも SSH 接続出来ないと書いてありますね。
それは、ログイン ID やパスワードが初期化されたからでは。
最初に加入したときの ID と パスを使ってもダメなんですか？

これは、なかなかに難しいかも知れないですね…。

VPS と言うのは、実際のところかなり不親切なところが多くて、標準 OS としている以外の OS を利用する場合、サポート対象外となるところがほとんどです。
また、サーバ管理ツールなども、標準 OS では便利ツールが充実していますが、それ以外の OS では最低限の基本機能しかない場合が多いですね。

それと、パッケージや OS のアップグレードなどは行わないことが基本です。
なぜかというと、VPS サーバで使われている OS は、サービス提供会社のポリシーに基づいてかなりカスタマイズされていることが多く、不用意にアップグレードすると、不具合が次から次に多発して無限ループ地獄に陥ることもあります。

取り敢えず、お名前のメンテナンスのせいならば、何とかログイン出来る状態にまではなるように、交渉するしかないかと。