ご返信いただきまして大変ありがとうございます。

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(1)uname -a
(2)dpkg -l | grep dovecot
(3)postconf -n
(4)sudo dovecot -n
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ご連絡いただいたコマンドの結果について、以下に記載して
おります。お手数ですが、ご確認のほどよろしくお願いいたします。

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(1)<kenny@kenny:~$ uname -a>
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Linux kenny 2.6.38-8-generic #42-Ubuntu SMP Mon Apr 11 03:31:50 UTC
2011 i686 i686 i386 GNU/Linux

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(2)<kenny@kenny:~$ dpkg -l |grep dovecot>
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ii  dovecot-common                        1:1.2.15-3ubuntu2.1
             secure mail server that supports mbox and maildir
mailboxes
ii  dovecot-pop3d                         1:1.2.15-3ubuntu2.1
             secure POP3 server that supports mbox and maildir
mailboxes

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(3)<kenny@kenny:~$ postconf -n>
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alias_database = hash:/etc/aliases
alias_maps = hash:/etc/aliases
append_dot_mydomain = no
biff = no
config_directory = /etc/postfix
inet_interfaces = all
mailbox_size_limit = 0
mydestination = kenny, localhost.localdomain, , localhost
myhostname = kenny
mynetworks = 192.168.35.0/24 [::ffff:127.0.0.0]/104 [::1]/128
readme_directory = no
recipient_delimiter = +
relayhost =
smtp_tls_session_cache_database = btree:${data_directory}/smtp_scache
smtpd_banner = $myhostname ESMTP $mail_name (Ubuntu)
smtpd_tls_cert_file = /etc/ssl/certs/ssl-cert-snakeoil.pem
smtpd_tls_key_file = /etc/ssl/private/ssl-cert-snakeoil.key
smtpd_tls_session_cache_database = btree:${data_directory}/smtpd_scache
smtpd_use_tls = yes

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(4)<kenny@kenny:~$ sudo dovecot -n>
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# 1.2.15: /etc/dovecot/dovecot.conf
# OS: Linux 2.6.38-8-generic i686 Ubuntu 11.04
log_timestamp: %Y-%m-%d %H:%M:%S
protocols: pop3 pop3s
ssl: no
disable_plaintext_auth: no
login_dir: /var/run/dovecot/login
login_executable: /usr/lib/dovecot/pop3-login
mail_privileged_group: mail
mail_location: maildir:~/Maildir
mbox_write_locks: fcntl dotlock
mail_executable: /usr/lib/dovecot/pop3
mail_plugin_dir: /usr/lib/dovecot/modules/pop3
auth default:
passdb:
   driver: pam
userdb:
   driver: passwd

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以上のようになっておりました。

どこの設定をかれば良いのか、まったく検討がつかない状況ですので、
恐縮ですが、アドバイスのほどよろしくお願いいたします。

配信されたメッセージの保存場所がすれ違ってます
　　Postfix： /var/mail に mailbox 形式のファイルとして
　　Dovecot： ~/Maildir に Maildir 形式で

ここでは Postfix を修正して Dovecot の Maildir 形式に合わせてみますね

sudo postconf -e "home_mailbox=Maildir/"
sudo service postfix restart

では～～～

kenyone777 による投稿:

そのため、「home_mailbox=Maildir」を「main.cf」内で
明示しない場合、postfixでは他の場所へメールが保存されて
しまう

Postfix は /var/mail ディレクトリにメールを保存するのが規定の動作として定義されています
main.cf で home_mailbox の値を設定すると、メールを保存する場所がユーザーのホームディレクトリ (その下の home_mailbox で指定したディレクトリ) に切り替わります
例えば、main.cf で home_mailbox を設定せず、代わりに mail_spool_directory の値を設定すると、mail_spool_directory で指定したディレクトリに全ユーザーのメールが保存されるようになります

main.cf で指定する値については、ちょっと古いですが Postfix設定パラメータ を斜め読みでも良いので目を通すことを勧めます
(最新版は Postfix Configuration Parameters ですが、英語です)

Postfix がメールを保存するディレクトリを規定の /var/mail のままにして、Dovecot 側で対処する方法もあります
/etc/dovecot/dovecot.conf ファイルの中の #mail_location = という行を mail_location = maildir:/var/mail/%u に書き替えれば良いでしょう

Dovecot の設定は、Dovecot Wiki (英語) を頑張って読み込むしか無いと思います