可変容量の仮想ディスクの場合、容量が増えてしまった後は仮想マシン内のOSから
ファイルを削除しても、仮想ディスクのサイズは減りません。

ホストOSからvmshrinkというツールを使えば仮想ディスクの容量を減らすことができます。
vmshrinkの使い方はGoogleして頂くとそこそこ出てくるはずです。

vmshrinkを使用したところ
3.78GB→2.72GBになりました。
さらに圧縮したところ1GB程度になりました。

おかげさまで目標値に近い大きさになりました。
ありがとうございました。