説明が不十分で失礼しました。

funatogawa による投稿:

メディア関連を開くと

よく使われるアプリ　　　　　←これが出ないのですか。
インストール済のアプリ
ダウンロード関連のアプリ

と出てきますが。

はい、このケースです。
他にも、「インターネット関連」「それ以外」Launcherの「アプリケーション」を押下しても、同じく「よく使われるアプリ」だけ表示されません。

funatogawa による投稿:

Dashを開くと、左から、

コード:

~$ unity --reset

で、どうなりますか。

症状は変わりませんでした。
試しに、いくつかのアプリを10回程度起動して、「よく使われるアプリ」が表示されないか試してみましたが、変わらずでした。

問題が同じかどうか分かりませんが、

”recent applications”と”"Most Frequently Used" Application”が同じかどうか分かりませんが
”"Most Frequently Used" Application”desappearedのほうの解決策はありませんでしたが、
http://askubuntu.com/questions/56783/un … tall-unity

does not show ”recent applications”の方は解決策が示されていました。
http://askubuntu.com/questions/48100/my … o-fix-that
それによると、「The solution was to reinstall unity-place-applications and unity-place-files packages and the Dash magically works.」だそうです。
synapticで、検索、再インストールしてみてください。

funatogawa による投稿:

does not show ”recent applications”の方は解決策が示されていました。
http://askubuntu.com/questions/48100/my … o-fix-that
それによると、「The solution was to reinstall unity-place-applications and unity-place-files packages and the Dash magically works.」だそうです。
synapticで、検索、再インストールしてみてください。

再インストールしてみましたが、症状は変わらずでした。
Zeitgeistのダウングレードは試してません。

funatogawa による投稿:

こんなHPもありました。参考にしてください。
Ubuntu 11.04で最近使用したファイルなどZeitgeistの履歴をすべて削除する方法@ubuntuapps.blog67.fc2.com

こちらも変わらずでした。

試しにゲストセッションでUnityを暫く触ったところ、あっさり「よく使われるアプリ」が表示されました。
そこでご提供の情報をヒントに ~/.local/share/zeitgeist をまるごと削除して再ログインしましたところ、普段のデスクトップでも「よく使われるアプリ」が表示されるようになりました。
結局不具合原因はわからずですが、これでメニュー操作がスピードアップできます。

お調べ下さった情報をヒントにすることができました。
funatogawaさん大変ありがとうございました。