自分の環境ではUnity、GNOME Shellとも問題なく動きます。(/dev/sda5を/に、/dev/sda6を/homeにマウントして使っています。)
Ubuntuに入っている「ディスクユーティリティ」を使うと、ハードディスクの状態を調べられます。参考にしてください。

パッケージのアップデートに関しては、時々(特にアルファ・ベータ版では)パッケージングのミスと思われる削除指定が起こるので、一つ一つ確認するようにしています。

GNOME ShellはCanonicalのサポート対象外なので、UbuntuはGNOME Shellの出来具合がどうであろうと10月13日にリリースされるはずです。
UnityもGNOME Shellも新しいデスクトップ環境で、両者とも多くの利点欠点がありますよね。

seijunです。

gnome-shellがうまく動いていたのですが、小生の環境では、gnome-tweak-toolをインストールし、標準の字体設定などの変更を行うと、gnome-shellが起動しなくなりました。
ハードウェア構成によっては、あるいは、コンピューターの作り方ないしハードウェアによっては、gnome-shellが動かなくなる場合があるようです。

正式版が公開されましたら、インストールして試してみようと思います。

seijunです。jmatsuzawaさん、どうも有難うございました。下記については、自宅で調べてみます。gnome-tweak-toolをインストールすると問題が発生するらしいことはわかりましたが、深い原因がよく分からず、今のところ、gnome-shellを使うには再インストールしかない状況です。ただ、gnome-tweak-toolは初期設定ではみすぼらしい限りです。元の「外観」でデフォルトフォントやデスクトップ背面画像を変更できるようにしてもらいたいとは思いますが、もう、仕方がないのでしょう。

jmatsuzawa による投稿:

seijunさん
jmatsuzawaと申します。
gnome-shellが起動しないということですが、
~/.xsession-errors
に何かログが出ていると思われますので、まずそちらを確認してみてはいかがでしょうか。

会社のコンピューターも11.04/11.10併用（デュアルインストール）ですが、gnome-tweak-toolを入れていましたので、gnome-shellが起動してなかったようです。10月11日版の遅いもの？を再インストールし、gnome-tweak-toolをインストールしないで、gnome-shellを使っています。

技術評論社のニュースサイトを見てみましたら、11.10はGnome3もサポートする旨、記載されていました。Unityを作る必要が果たしてあったのか、個人的には疑問なところではあります。11.04ではどうしてもUnityに馴染めず、Gnome2を使っていました。

11.10が正式公開されましたら、gnome-tweak-toolインストール後の状況によっては、バグ報告してみます。

seijunです。sdaのパーティションのサイズを変更して正式版の64ビット版をクリーンインストールしましたが、やはり、テーマをMetaboxにすると、Gnome-Shellが正しく起動しませんでした。

これは、やはり、バグっぽいので報告しておこうと思いますが。なお、Fedora15には、gnome-tweak-toolはyumでインストールできるものの、テーマにはMetaboxがないようです。小生の見間違いでしたら、ごめんなさい。

二重に投稿していたらすみません(タイムアウトしたので・・・)

seijunさん
同じ事を何度も繰り返されているようですが・・・

seijun による投稿:

これは、やはり、バグっぽいので報告しておこうと思いますが。

バグ報告しようと思っているのであれば、まずこちらからどうぞ。
gnome-tweak-toolでMetaboxのテーマを指定したらgnome-shellが起動しない、と問題を特定できたのであれば、まず既知バグを確認した方がいいですよ。
Metaboxでgnome-shellのバグを検索すれば、すぐにバグレポートが見つかります (見つけられなかった場合でも新規報告の際にバグトラッキングシステムが類似バグを教えてくれるので、その時気づくはずです)。
https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/gnome-shell/+bug/862242
おそらく、これと同事象ではないでしょうか?
で、テーマの問題だからテーマの開発者に報告しろと回答がついています。
Metaboxテーマを提供するのはmetacityのパッケージで、そちらではまだ報告されていないようなので、そちらに報告してはいかがでしょうか?

ただ、これは観点をどこに置くかによって問題の捉え方も変わってくるので、seijunさんが最も問題とする観点で報告するのが良いかと思います。
たとえば、以下のように問題の捉え方は様々です。
* Metaboxがgnome-shellに対応していないのが問題 => metacityの問題
* 対応していないMetaboxをテーマに指定した場合にgnome-shellが起動できないのが問題(デフォルトのアドワイチャでも代わりを使えばいい) => gnome-shellの問題
* 対応していないテーマを一覧に表示するgnome-tweak-toolが悪い => gnome-tweak-toolの問題

seijun による投稿:

なお、Fedora15には、gnome-tweak-toolはyumでインストールできるものの、テーマにはMetaboxがないようです。小生の見間違いでしたら、ごめんなさい。

いいえ、Fedoraにもあります。
metacity自体はアップストリームのもので、おそらくこれはディストロ固有の問題でもない(要するにアップストリーム側の問題)と思われるので、アップストリーム側に報告するという手もありでしょう。
アップストリームのバグトラッキングシステムはこちらです。ご参考までに。
https://bugzilla.gnome.org/

jmatsuzawaです。

seijun による投稿:

で、Metaboxを選択すると、Gnome-Shellが正常に立ち上がらなくなります。ctrl+alt+delでログイン画面に戻りますが、Unityがないので、修復ができない状況です。デスクトップにターミナルのランチャーアイコンを貼りつけておけば何とかなったかも知れませんが、あとの祭りです。

ご心配は無用です。
とりあえず、当面の復旧方法をお伝えいたします (UbuntuもFedoraも共通です)。

1. 通常通りGUIログイン画面(ディスプレイマネージャー)までOSを起動してください。
2. Ctrl+Alt+F2 などで仮想コンソールに移ってください(CUIになります)。
3. 該当(お使い)のアカウント(gnomes-shellが起動しなくなったアカウント)でCUIログインしてください。
4. 以下のコマンドを続けて実行してください。
   $ gconftool-2 --set "/desktop/gnome/shell/windows/theme" --type string "Adwaita"
   $ gconftool-2 --set "/apps/metacity/general/theme" --type string "Adwaita"
   (上記のコマンドはgnome-shellおよびmetacityのテーマをデフォルトのAdwaita(アドワイチャ)に設定します。gnome-tweak-toolからテーマを設定した場合、gnome-tweak-toolは内部で同様の処理を行なっています。)
5. 仮想コンソールからログアウトして、またCtrl+Alt+FN (Nは何かしらの数字)でGUIログイン画面(ディスプレイマネージャー)に戻ってください。
6. 該当のアカウントでgnome-shellを使用してログインできるはずなので、ログインしてください。

seijunです。Ubuntuの話題ですが、参考までにFedora 15 64Bit版では問題ありませんでした。

seijun@localhost ~$ rpm -qa | grep gnome-tweak-tool
gnome-tweak-tool-3.0.5-2.fc15.noarch

問題のUbuntu版のgnome-tweak-toolは、3.2.xのようです。