見当違いかも知れませんが、日本語のフォルダ名が悪影響しているかも？
ダウンロードをDownloadなど１バイト系のフォルダ名を新たに作成して、そちらにEIOfficeをコピーしてからインストール作業を行ってみてはいかがでしょうか？

ubuntao による投稿:

、~/ダウンロード/leiotri90it$ sudo ./setup.sh　と入力しても
パスワード入力後
sudo: ./setup.sh: command not found
と表示され、インストールできません。
ディレクトリの中にはsetup.shというファイルはあるのですが。

多分、実行権が付いていないのでは？
ファイルブラウザからだと、setup.sh の「プロパティ」表示し、「アクセス権」から、「プログラムとして実行できる」にチェックをつける。
端末内だと、コマンドで、「 chmod +x setup.sh 」で、実行権を追加してみる。

Readme ファイルの文字コードが euc で文字化けする可能性が高いので、エンコードしておきます。

Readme

ハードウェアに対する要求
主要適用機種：PC及び互換機
CPU：Pentium 3 450MHz,Pentium 4 1.3GHz以上推奨
メモリ：128MB、256MB以上推奨
ハードディスク空き容量：350MB以上
ディスプレイ：256色、スーパーVGA（800×600）以上
周辺装置の要求：標準キーボート、マウス
ドライブ：CD-ROM

ソフトフェアに対する要求
プラットフォーム（実行するシステム）：Windows98/ME/2000/XP/Vista、但しWindows2000はService Pack 2以上のバージョンが必要です。RedHat Linux8.0/9.0、turbolinux10.0/11のKDE環境です。Suse10、Ubuntu linuxです。
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EIOffice インストール
Windows：
方法1【パッケージの場合】：CD-ROMにEIOffice CDを挿入し、自動的にインストールウィザードが実行されます。あるいは、CD-ROMのディレクトリ内の実行ファイル<setup.exe>をダブルクリックすると、インストールウィザードが実行されます。
方法2【ダウンロードの場合】：ダウンロードされたEIOfficeプログラムフォルダ内の実行ファイル<setup.exe>をダブルクリックすると、インストールウィザードが実行されます。
Linux：
方法1：rootユーザーで端末のウィンドウを起動させます。CD-ROMにEIOffice CDを挿入し、CD-ROMのディレクトリ内の実行ファイル<setup.exe>をダブルクリックすると、インストールウィザードが実行されます。
方法2：rootユーザーで端末のウィンドウを起動させます。CD-ROMにEIOffice CDを挿入し、端末のコマンドラインでcd /mnt/cdrom/Linuxを入力しEnterキーを押すと、インストールディレクトリに入れます。そして./setupを入力しEnterキーを押すと、インストールウィザードが実行されます。
方法3（Ubuntu linuxのインストール方法）：
1、ユーザーで端末のウィンドウを起動させてrootのパスワードを設定します。
2、CD-ROMにEIOffice CDを挿入し、端末のウィンドウを起動させて端末の中にsudo passwd rootを入力してください。
3、「新しいUNIXパスワードを入力してください」と表示されたら、rootに設定するパスワードを設定します。
4、「新しいUNIXパスワードを再入力してください」と表示されたら、rootに設定したパスワードを再入力してください。
5、次に、端末にsu rootと入力し、「パスワード」と表示されたら、2番3番で設定したパスワードを入力してください。
最後にcd /cdrom/Linuxと入力し、次に./setupと入力すればインストールウィザードが起動しますので内容に従ってインストールしてください。

EIOfficeアンインストール
Windows：
Windows OS のスタートメニュ->すべてのプログラム->EIOffice->EIOfficeの追加あるいは削除を選択し、表示されたインストールウィザードに従ってEIOfficeを削除することができます。
Linux：
方法1：Rootユーザーで端末のウィンドウを起動させます。スタートメニューのEIOfficeアンインストールのショートカットをクリックし、表示されたアンインストールウィザードの内容に従ってアンインストールすることができます。
方法2：Rootユーザーで端末のウィンドウを起動させます。端末のコマンドラインでrmeioを入力しEnterキーを押します。表示されたアンインストールウィザードの内容に従ってアンインストールすることができます。
方法3（Ubuntu linuxの場合）：ユーザー端末のウィンドウを起動させます。端末のコマンドラインでsu rootと入力し、インストール時に設定したrootユーザーのパスワードを入力します。次に、rmeioと入力するとアンインストールウィザードが起動しますので内容に従ってアンインストールします。

付注
1、EIOfficeをインストールする前に、前バージョン、又は体験版をご利用の方はそれらをアンインストールする必要があります。
2、EIOfficeのインストールと設定はrootユーザーのみが行うことが出来ます。ユーザーがrootユーザーでない場合は（例えば、Aユーザー）、Aユーザーの端末のコマンドラインでseteioを実行すると、AユーザのデスクトップでEIOfficeのショートカットを作成することができます。
3、インストールを完了後、デスクトップまたはスタートメニューにEIOfficeのショートカットがない場合は、再起動する必要があります。
4、Setupをダブルクリックしても反応がない場合は、このファイルに実行権限がないため、実行権限を与えてから、再実行してください。

お礼を書くのを忘れていました。ごめんなさい。
回答してくださった皆様、ありがとうございました！

orz…

STGSAGWAN による投稿:

「$sudo passwd root」はインストールするにあたって特にする必要のない操作ですね。
(こんな事をさせるマニュアルが変とは思いませんか？＞ALL)

コード:

sudo usermod -L root

で元の状態に戻しておく方がよいと思います。

そこまで、Readme の内容を見てなかった…。
って言うか、まったく読んでなかったことがバレバレに(汗
ubuntao さん、STGSAGWAN さんの書き込みを参考に、root のパスワードを削除しておいてください。