大体いつもは正常に起動するのですが、ほんとうに時々タイトルのような現象が発生します。
どのような条件で発生するのかもわかりません。
具体的な症状は

・gnomeパネル上のランチャがクリックできなくなる
・ウィンドウの移動・閉じる・スクロールなどのウィンドウ操作ができなくなる
・ウェブブラウザを開いた場合もリンクをクリックできない

というような症状です。
マウスが壊れているわけでなく、なぜかGnoMenuはクリックできたり、右クリックからファイルのプロパティを開いたりはできるようです。
また、キーボードは動きますのでそれによって端末を開いてアプリケーションを開いたり、ウィンドウを閉じたり、OSの再起動をしたりできます。
毎度再起動して直しています。

このような現象の場合ウィンドウマネージャやらディスプレイマネージャやらが原因なのでしょうか？