レスがつかないようなんので外しているかもしれないが、"mplayer 音ずれ"で検索した内容をあげます。

mplayerによるwmv再生で音ずれに対策する方法はいくつかあるようだ。
下記URLを参考にしてください。

・TODAY'S SAMETHING:今日のmplayerの音ずれ解消のナゾ

・MOBILEHACKERZ:音ずれについて

後々調べて見たところ、manページにコーデックによっては-correct-ptsオプションが効かないということが載っていました。
       -correct-pts (EXPERIMENTAL)
              Switches MPlayer to an experimental mode  where  timestamps  for
              video  frames are calculated differently and video filters which
              add new frames or modify timestamps of existing  ones  are  sup‐
              ported.  The more accurate timestamps can be visible for example
              when playing subtitles timed to scene changes with the -ass  op‐
              tion.   Without  -correct-pts the subtitle timing will typically
              be off by some frames.  This option does not work correctly with
              some demuxers and codecs.