mjww 様へ．

おそらく，デフォルトでは flashplugin-installer がインストールされていると
思いますが，adobe-flash-properties-gtk をインストールすると
良いかもしれません．

adobe-flash-properties-gtk は，flash の設定を flash 上にでは無く，
GTK の別ウィンドウに表示するものです．
flashplugin-installer とは競合するので，adobe-flash-properties-gtk を
インストールすると flashplugin-installer は削除されてしまいますが，
機能的にはほぼ同等なので，問題ないはずです．

設定をするには，Unity の dash や synapse 等で "flash" と入力すれば
"Adobe flash player" という選択肢が出てくるはずですので，
それを起動すれば，設定画面が現れます．
そこで，設定すれば，問題は解決するはずです．

サイトごとの設定については，その flash 上で設定画面を出すと(クリックできませんが)，
GTK 版の設定に，そのサイトが追加されていますので，そこで許可の設定を
すれば良いと思います．
(もしかしたら，そのサイトを表示させるだけで追加されるかもしれませんが，そこは当方，未確認です．)

設定画面をクリックできない問題については，
既に報告済みの問題のようですね．

hellfire様へ

今回はありがとうございました解決することが出来ました＾＾