GNOME のキーボード・ショートカット機能が、PC-Xサーバ（ASTEC-X)からの
キーイベントを横取りしているのが原因でした。デスクトップのパネル・メニューから
システム→設定→キーボードショートカット　のパネルを開く。

”サウンド”　の　”ミュート（消音）にする”　：　左シフトキー
”デスクトップ”　の "Launch calculator" ：　右シフトキー
この２つの設定を無効に変更する。

これでShiftキーが効くようになりました。