調べてみたところ、fslviewと恐らく同じソフトが、
http://pkgs.org/ubuntu-12.04/ubuntu-multiverse-amd64/fsl-4.1_4.1.8-1ubuntu1_amd64.deb.html

として、12.04でも提供されているようです。

multiverse repositoryに入っているので、ソフトウェア・ソースの画面上でmultiverseを使用するようにチェックを入れて、
sudo apt-get update
sudo apt-get install fsl-4.1
を実行して下さい。

taka8さん

kiyoonと申します。Lin4Neuroの作者です。Lin4Neuroを利用していただきありがとうございます。
さて、FSLViewの件ですが、Ubuntu 11.10以降、FSLViewは利用できなくなっています。
FSLViewはQt3を利用しているのですが、Ubuntu 11.10以降、Qt3は利用できなくなっています。
そのため、FSLViewを使うことができなくなってしまいました。

Lin4NeuroはUbuntu 10.04 LTSをベースにカスタマイズしていますので、FSLViewを問題なく使うことができます。

どうしてもUbuntu 12.04で使いたい場合の方法が以下のリンクに記載されています。

http://neuro.debian.net/blog/2011/2011-12-12_schroot_fslview.html?highlight=fslview

それと、NeurodebianのMLでも、「じゃあ、Viewerは何を使うといいんだい？」という話題になっています。

http://web.archiveorange.com/archive/v/FQvMCpTD5FA000DhcKEj

もし、FSLViewをお使いになりたいのであれば、Lin4Neuroを使っていただくのが無難かと思います。

願わくば、Qt4に対応したFSLViewが近いうちに発表されるといいのですが。

以上、ご参考になれば幸いです。