私は「Brasero」を使っています。
起ち上げると、「ディスクのコピー(C)」（CD/DVDを丸ごとコピーします)というボタンが有ります。
コピーが終わってディスクを取り出し、CD-Rに入れ替える際に、マウント関係のメッセージが出て来ますが、
気にせずCD-Rを挿入してコピーを続行すれば、問題無く書き込めました。