sakurako による投稿:

何も考えずにupdateを実行してしまいました。

update中に「Grubがインストールされていないので、インストール」するよう促すメッセージが表示され
Grubをインストールする場所を指定するように言われました。

この場合、Grubをインストールしたほうがよいのでしょうか？
それとも、スキップしてもよいのでしょうか？

また仮想環境でもupdateは普通に行っても問題はないのでしょうか？

大変基本的な質問で申し訳ありませんが、何卒ご回答よろしくお願いいたします。

ひょっとしてホスト環境が壊れることを心配されているのでしょうか?
私もVirtualBoxを使っているので実際にやってみました。
/dev/sdaと/dev/sda1の両方にGrubをインストールしてみました。エラーメッセージが出ましたが、その後何事もなくUbuntuは起動しました。
またホストOSが壊れることもありませんでした。
基本的にVirtualBoxの中で起こっていることは仮想マシンの中で起こっていることなのでホストに悪影響を及ぼすことはないはずです。(バグなどでない限り)
仮想マシンでGrubをインストールするように言われても、それは仮想マシン上での話です。
仮想環境でもupdateは行たほうがよいと思います。