12.04 LTSのユーザです。

外付けHDDへのインストールは、なかなか手強いです（少なくとも私には）。

このフォーラム中、「外付けHDDへのインストール」で検索すると過去の議論がゾロゾロ出てきます。例えば、
https://forums.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=13499

どうしても、USB/HDDへのインストールをされたいのであれば、以下は読み飛ばしてください。上級者からアドバイスがあると思います。

UNIXは若いころから使っています。Windows機本体のHDDになんら影響をおよぼしたくなかったので、wanwanoさんと同じく悩んだ結果、諦めました。ブートローダやPCとの相性問題がありました。お勧めは、本体のHDDに「デュアル・ブート」することです。記録にある限り２０台以上に、Ubuntuをインストールしましたが特に問題はありません。OSやウイルス対策ソフトにお金をつぎ込むことがもったいないと感じるようになり、現在プライベートで使用している3台すべてUbuntuのみで運用しています。

PCがUSB Mediaからの起動に対応しているのであれば、USBメモリにOSをインストールして、データードライブ（Ntfs）を共有する方法であれば、WindowsとUbuntuは独立した形態で操作出来ますので、USB-HDDに頼らなくとも
希望の環境が構築できると思います。下記にUSBメモリへのインストールその他の解説がされています。
http://www11.ocn.ne.jp/~ksoft/ubuntu.html
中で解説されている「UNETBOOTIN」は私も愛用していますがWindowsからの使用も可能で「Ubuntu」のインストールにおいてはLiveCDの2/3の時間で完了する、優れものです使用を推奨します。

今日は。shingenといいます。
wanwanoさんの手順から考えて、パーティションを手動で行うを選定してインストールされていると思いますが、質問にあるように、ただ、/　が定義されていないだけでしょう。

これを定義するには、インストールの種類の画面で、インストールするパーティションを選択するはずですが、選択してからすぐインストールするのではなく、その下のほうにある、変更ボタンを一旦クリックして、その後現れた画面にて、/ を定義すればいいのではないのでしょうか。その画面の名称は忘れてしまいましたが、定義の仕方は分かると思いますよ。

自分も外付けUSBーHDDにインストールして使っています。多少動きがもっさりするものの、それを使うことにより、内臓HDDの寿命も伸びると思います。取り外せば、ウインドウズが今までどおり使えますし、とてもいいですよ。(自分の場合は、内臓HDDにもインストールしてしまったので、後悔していますが、普段は、外付けHDDのUbuntuを使っています。）

私もUSBメモリ、USB-HDDでLubuntuを使用しています。

質問への直接の回答ではありませんが私も以前はUSB機器へのインストールには苦労してました。が、最近VMwarePlayerでのインストール方法を知ってからは格段に簡単かつ速くインストールできるようになりました。メインマシンがそこそこパワーがありVMwarePlayerがインストール可能でしたら一度試してみてはいかがですか？

私はUSBメモリにインストールすることが多いのですがUbuntu(Unity)は、しばらく使っていると起動しなくなってしまうことが多いです。（使っているUSBメモリの品質のせいかもしれませんが・・・）それに比べてLubunut(LXDE)は全く問題がありません。動作も格段に軽いのでいいですよ。